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Enregistrement W2998887124 · doi:10.1080/23802359.2019.1710607

Complete mitogenomes of the chlorophycean green algae <i>Bulbochaete rectangularis</i> var. <i>hiloensis</i> (Oedogoniales) and <i>Stigeoclonium helveticum</i> (Chaetophorales) provide insight into the sequence of events that led to the acquisition of a reduced-derived pattern of evolution in the Chlamydomonadales and Sphaeropleales

2020· article· en· W2998887124 sur OpenAlexafffund
Monique Turmel, Anne-Sophie Bélanger, Christian Otis, Claude Lemieux

Notice bibliographique

RevueMitochondrial DNA Part B · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyChlorophyceaeCladeBotanyEvolutionary biologyAlgaeGenePhylogenetic treeGeneticsChlorophyta

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitogenome evolution in the Chlorophyceae is characterized by the acquisition of a reduced-derived pattern by the Chlamydomonadales + Sphaeropleales clade. Because no mitogenomes are available for the sister clade Oedogoniales + Chaetophorales + Chaetopeltidales, it remains unclear whether the common ancestor of chlorophycean green algae harbored a reduced-derived or ancestral-type mitogenome. The 70,191 and 46,765-bp mitogenomes reported here for Bulbochaete rectangularis var. hiloensis (Oedogoniales) and Stigeoclonium helveticum (Chaetophorales), respectively, shed light on this question. Both contain the same set of 41 conserved genes, a repertoire lacking numerous protein-coding genes but featuring all 27 tRNA genes typically found in ancestral-type mitogenomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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