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Enregistrement W2998953092 · doi:10.1002/alz.12011

Genetic screening of a large series of North American sporadic and familial frontotemporal dementia cases

2020· article· en· W2998953092 sur OpenAlexaff
Eliana Marisa Ramos, Deepika Dokuru, Victoria Van Berlo, Kevin Wojta, Qing Wang, Alden Huang, Sandeep Deverasetty, Yue Qin, Marka van Blitterswijk, Jazmyne L. Jackson, Brian S. Appleby, Yvette Bordelon, Patrick Brannelly, Danielle Brushaber, Bradford C. Dickerson, Susan Dickinson, Kimiko Domoto‐Reilly, Kelley Faber, Julie A. Fields, Jamie Fong, Tatiana Foroud, Leah K. Forsberg, Ralitza H. Gavrilova, Nupur Ghoshal, Jill Goldman, Jonathan Graff‐Radford, Neill R. Graff‐Radford, Ian Grant, Murray Grossman, Hilary W. Heuer, Ging‐Yuek Robin Hsiung, Edward D. Huey, David J. Irwin, Kejal Kantarci, Anna Karydas, Daniel Kaufer, Diana Kerwin, David S. Knopman, John Kornak, Joel H. Kramer, Walter K. Kremers, Walter A. Kukull, Irene Litvan, Peter A. Ljubenkov, Codrin Lungu, Ian R. Mackenzie, Mario F. Mendez, Bruce L. Miller, Chiadi U. Onyike, Alexander Pantelyat, Rodney Pearlman, Len Petrucelli, Madeline Potter, Katherine P. Rankin, Katya Rascovsky, Erik D. Roberson, Emily Rogalskı, Leslie M. Shaw, Jeremy A. Syrjanen, Maria Carmela Tartaglia, Nadine Tatton, Joanne Taylor, Arthur W. Toga, John Q. Trojanowski, Sandra Weıntraub, Bonnie Wong, Zbigniew K. Wszołek, Rosa Rademakers, Bradley F. Boeve, Howard J. Rosen, Adam L. Boxer

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthNational Institute on Aging
Mots-clésC9orf72Frontotemporal dementiaTARDBPFrontotemporal lobar degenerationGeneticsPSEN1MedicineBiologyDementiaPresenilinDiseasePathologyAlzheimer's disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The Advancing Research and Treatment for Frontotemporal Lobar Degeneration (ARTFL) and Longitudinal Evaluation of Familial Frontotemporal Dementia Subjects (LEFFTDS) consortia are two closely connected studies, involving multiple North American centers that evaluate both sporadic and familial frontotemporal dementia (FTD) participants and study longitudinal changes. METHODS: We screened the major dementia-associated genes in 302 sporadic and 390 familial (symptomatic or at-risk) participants enrolled in these studies. RESULTS: Among the sporadic patients, 16 (5.3%) carried chromosome 9 open reading frame 72 (C9orf72), microtubule-associated protein tau (MAPT), and progranulin (GRN) pathogenic variants, whereas in the familial series we identified 207 carriers from 146 families. Of interest, one patient was found to carry a homozygous C9orf72 expansion, while another carried both a C9orf72 expansion and a GRN pathogenic variant. We also identified likely pathogenic variants in the TAR DNA binding protein (TARDBP), presenilin 1 (PSEN1), and valosin containing protein (VCP) genes, and a subset of variants of unknown significance in other rare FTD genes. DISCUSSION: Our study reports the genetic characterization of a large FTD series and supports an unbiased sequencing screen, irrespective of clinical presentation or family history.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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