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Enregistrement W2998994512 · doi:10.1101/2020.01.15.907899

Target of Rapamycin: function in abiotic stress tolerance in Arabidopsis and its involvement in a possible cross-talk with ribosomal proteins

2020· preprint· en· W2998994512 sur OpenAlexaff
Achala Bakshi, Mazahar Moin, M. Sheshu Madhav, Meher B. Gayatri, Aramati B. M. Reddy, Raju Datla, Pulugurtha Bharadwaja Kirti

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensGlobal Institute for Water Security
Organismes subventionnairesChristopher S. Bond Life Sciences Center, University of MissouriIndian Council of Agricultural ResearchUniversity of Missouri
Mots-clésArabidopsisBiologyAbiotic stressRibosomal proteinOsmotic shockCell biologyDownregulation and upregulationArabidopsis thalianaTransgeneGeneBiochemistryRibosomeMutantRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Target of Rapamycin (TOR) protein kinase reprograms cellular metabolism under various environmental stresses. The overexpression of TOR in Arabidopsis resulted in increased plant growth including yield and biomass when compared with the wild type under both controlled and limited water conditions. In the present investigation, we report that Arabidopsis plants overexpressing TOR exhibited enhanced tolerance to the osmotic and salt stress treatments. Further to determine the role of TOR in abiotic stresses other than water limiting conditions, which were observed earlier in rice, we have treated high and medium TOR expressing Arabidopsis plants, ATR-1.4.27 and ATR-3.7.32 respectively, with stress-inducing chemical agents such as Mannitol (100 mM), NaCl (150 mM), Sorbitol (200 mM) and PEG (7%). Both the lines, ATR-1.4.27 and ATR-3.7.32 exhibited enhanced tolerance to these stresses. These lines also had increased proline and total chlorophyll contents under stress conditions compared with their corresponding WT counterparts. The upregulation of several osmotic stress inducible genes in Arabidopsis transgenic lines indicated the role of TOR in modulating multi-stress tolerance. In the present investigation, we have also analyzed the transcriptional upregulation of ribosomal protein large and small subunit (RPL and RPS) genes in AtTOR overexpressing rice transgenic lines, TR-2.24 and TR-15.1 generated earlier (Bakshi et al., 2017a), which indicated that TOR also positively regulates the transcription of ribosomal proteins (RP) along with the synthesis of rRNAs. Also, the observations from phosphoproteomic analysis in SALK lines of various Arabidopsis T-DNA insertion mutants of ribosomal proteins showed differential regulation in phosphorylation of p70kDa ribosomal protein S6K1 and comparative analysis of phosphorylation sites for RSK (Ribosomal S6 Kinases) in RPL6, RPL18, RPL23, RPL24 and RPS28C proteins of Arabidopsis, Interestingly, rice showed similarity in their peptide sequences and Ser/Thr positions. These results suggest that the phosphorylation of S6K1 is controlled by loss/ inhibition of ribosomal protein function to switch ‘on’/ ‘off’ the translational regulation for balanced growth and the pathways of both RPs and TOR are interlinked in a cyclic manner via phosphorylation of S6K1 as a modulatory step.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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