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Enregistrement W2999009349 · doi:10.1002/csc2.20035

Relative utility of agronomic, phenological, and morphological traits for assessing genotype‐by‐environment interaction in maize inbreds

2020· article· en· W2999009349 sur OpenAlexaff
Celeste M. Falcon, Shawn M. Kaeppler, Edgar P. Spalding, Nathan D. Miller, Nicholas Haase, Naser Alkhalifah, Martin Bohn, Edward S. Buckler, Darwin A. Campbell, Ignacio A. Ciampitti, Lisa Coffey, Jode W. Edwards, David Ertl, Sherry Flint-García, Michael A. Gore, Christopher Graham, Candice N. Hirsch, James B. Holland, Diego Jarquín, J. Knoll, Nick Lauter, Carolyn J. Lawrence‐Dill, Elizabeth C. Lee, Aaron J. Lorenz, Jonathan P. Lynch, Seth C. Murray, Rebecca Nelson, M. Cinta Romay, Torbert Rocheford, Patrick S. Schnable, Brian T. Scully, Margaret E. Smith, Nathan M. Springer, Mitchell R. Tuinstra, R. B. Walton, Teclemariam Weldekidan, Randall J. Wisser, Wenwei Xu, Natalia de León

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetics and Plant Breeding
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceNational Institute of Food and AgricultureNebraska Corn BoardNational Science FoundationIowa State UniversityUniversity of Wisconsin-MadisonU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyTraitGene–environment interactionQuantitative trait locusPhenologyVariance componentsAgronomySowingGenotypeGrowing seasonPhenotypic traitYield (engineering)PhenotypeGeneticsStatisticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plant breeders face the challenge of genotype × environment interaction (G × E) in comprehensively breeding for expanded geographic regions. An improved understanding of G × E sensitivity of traits and the environmental features that effectively discriminate among genotypes will enable more efficient breeding efforts. In this study of 31 maize ( Zea mays L.) inbreds grown in 36 environments that are part of the Genomes to Fields Initiative, we measured 14 traits, including flowering date, height, and yield components (i.e., ear and kernel dimensions) to (i) identify traits that are the most sensitive indicators of G × E; (ii) determine how geographic location and weather factors influence environments’ discriminability of inbreds; and (iii) detect patterns of stability in better and worse discriminating environments. Genotype × environment interaction explained between 9.0–20.4% of the phenotypic variance with greater effects in the yield‐component traits. Discriminability of environments varied by trait. Midwest locations (where 26 of the 31 inbreds were developed) were among the most discriminating environments for more traits, while environments in the West and East tended to be less discriminating. Weather factors during silking were significantly different between the most and least discriminating environments more often than average weather across the season or during the period from planting to silking. Stability of genotypes varied by trait, and performance was usually not correlated with stability. The dissection of complex traits, such as yield into component traits, appears to be a useful approach to understand how environmental factors differentially affect phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,963
Score d'incertitude au seuil0,124

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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