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Enregistrement W2999057493 · doi:10.1371/journal.pone.0226784

Selection of memory clinic patients for CSF biomarker assessment can be restricted to a quarter of cases by using computerized decision support, without compromising diagnostic accuracy

2020· article· en· W2999057493 sur OpenAlexaboutno aff
Hanneke Rhodius‐Meester, Ingrid S. van Maurik, Juha Koikkalainen, Antti Tolonen, Kristian Steen Frederiksen, Steen Gregers Hasselbalch, Hilkka Soininen, Sanna-Kaisa Herukka, Anne M. Remes, Charlotte E. Teunissen, Frederik Barkhof, Yolande A.L. Pijnenburg, Philip Scheltens, Jyrki Lötjönen, Wiesje M. van der Flier

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGenentechHorizon 2020 Framework ProgrammeGIESKES-STRIJBIS FONDSAmsterdam NeuroscienceStichting DioraphteNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekEuropean CommissionRoche NederlandNational Institute for Health and Care ResearchAlzheimer NederlandTeknologian Tutkimuskeskus VTTZonMwDanoneBiogenPfizer
Mots-clésQuarter (Canadian coin)Selection (genetic algorithm)BiomarkerMedicineBioinformaticsComputer scienceMedical physicsArtificial intelligenceBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: An accurate and timely diagnosis for Alzheimer's disease (AD) is important, both for care and research. The current diagnostic criteria allow the use of CSF biomarkers to provide pathophysiological support for the diagnosis of AD. How these criteria should be operationalized by clinicians is unclear. Tools that guide in selecting patients in which CSF biomarkers have clinical utility are needed. We evaluated computerized decision support to select patients for CSF biomarker determination. METHODS: We included 535 subjects (139 controls, 286 Alzheimer's disease dementia, 82 frontotemporal dementia and 28 vascular dementia) from three clinical cohorts. Positive (AD like) and negative (normal) CSF biomarker profiles were simulated to estimate whether knowledge of CSF biomarkers would impact (confidence in) diagnosis. We applied these simulated CSF values and combined them with demographic, neuropsychology and MRI data to initiate CSF testing (computerized decision support approach). We compared proportion of CSF measurements and patients diagnosed with sufficient confidence (probability of correct class ≥0.80) based on an algorithm with scenarios without CSF (only neuropsychology, MRI and APOE), CSF according to the appropriate use criteria (AUC) and CSF for all patients. RESULTS: The computerized decision support approach recommended CSF testing in 140 (26%) patients, which yielded a diagnosis with sufficient confidence in 379 (71%) of all patients. This approach was more efficient than CSF in none (0% CSF, 308 (58%) diagnosed), CSF selected based on AUC (295 (55%) CSF, 350 (65%) diagnosed) or CSF in all (100% CSF, 348 (65%) diagnosed). CONCLUSIONS: We used a computerized decision support with simulated CSF results in controls and patients with different types of dementia. This approach can support clinicians in making a balanced decision in ordering additional biomarker testing. Computer-supported prediction restricts CSF testing to only 26% of cases, without compromising diagnostic accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,032
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,032
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,108
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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