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Enregistrement W2999149677 · doi:10.1101/2020.01.09.901041

Hypercholesterolemia risk associated GPR146 is an orphan G-protein coupled receptor that regulates blood cholesterol level in human and mouse

2020· preprint· en· W2999149677 sur OpenAlexaff
Fangfang Han, Xiao Liu, Chuanfang Chen, Yinan Liu, Mingkun Du, Yangyang Guan, Yiliang Zhang, Dehe Wang, Musaddeque Ahmed, Xuedan Li, Xiaomin Liu, Yuxian Wu, Yu Zhou, Yong Liu, Bao‐Liang Song, Housheng Hansen He, Yan Wang

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaFundamental Research Funds for the Central UniversitiesHigher Education Discipline Innovation ProjectState Key Laboratory of Natural MedicinesChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLocus (genetics)AlleleBiologyGenome-wide association studyCholesterolOrphan receptorReceptorFamilial hypercholesterolemiaDyslipidemiaEndocrinologyGeneticsInternal medicineGeneGenotypeSingle-nucleotide polymorphismMedicineDiabetes mellitusTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome-wide association studies (GWAS) have identified hundreds of genetic variants associated with dyslipidemia. However, about 95% of of these variants are located in genome noncoding regions and cluster in different loci. The disease-causing variant for each locus and underline mechanism remain largely unknown. We systematically analyzed these noncoding variants and found that rs1997243 is the disease-causing variant in locus 7p22, which is strongly associated with hypercholesterolemia. The rs1997243 risk allele is associated with increased expression of GPR146 in human and targeted activation of the rs1997243 site specifically up regulates GPR146 expression in cultured cells. GPR146 is an orphan G-protein coupled receptor that is located on plasma membrane and responses to stimulation of heat-inactivated serum. Disrupting gpr146 specifically in the liver decreases the blood cholesterol level and prevents high-fat or high-fat high-cholesterol diets induced hypercholesterolemia in mice. Thus we uncovered a novel G-protein coupled receptor that regulates blood cholesterol level in both human and mouse. Our results also suggest that antagonizing GPR146 function will be an effective strategy to treat hypercholesterolemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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