Calcium affects CHP1 and CHP2 conformation and their interaction with sodium/proton exchanger 1
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Calcineurin B homologous proteins (CHPs) belong to the EF‐hand Ca 2+ ‐binding protein (EFCaBP) family. They have multiple important functions including the regulation of the Na + /H + exchanger 1 (NHE1). The human isoforms CHP1 and CHP2 share high sequence similarity, but have distinct expression profiles with CHP2 levels for instance increased in malignant cells. These CHPs bind Ca 2+ with high affinity. Biochemical data indicated that Ca 2+ can regulate their functions. Experimental evidence for Ca 2+ ‐modulated structural changes was lacking. With a newly established fluorescent probe hydrophobicity (FPH) assay, we detected Ca 2+ ‐induced conformational changes in both CHPs. These changes are in line with an opening of their hydrophobic pocket that binds the CHP‐binding region (CBD) of NHE1. Whereas the pocket is closed in the absence of Ca 2+ in CHP2, it is still accessible for the dye in CHP1. Both CHPs interacted with CBD in the presence and absence of Ca 2+ . Isothermal titration calorimetry (ITC) analysis revealed high binding affinity for both CHPs to CBD with equilibrium dissociation constants ( K D s) in the nanomolar range. The K D for CHP1:CBD was not affected by Ca 2+ , whereas Ca 2+ ‐depletion increased the K D 7‐fold for CHP2:CBD showing a decreased affinity. The data indicate an isoform specific regulatory interaction of CHP1 and CHP2 with NHE1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».