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Enregistrement W2999349368 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjz203.820

P692 Exploring relationships between microbiome, faecal calprotectin and healthy eating index in patients with ulcerative colitis: Interim analyses of a randomised controlled trial

2020· article· en· W2999349368 sur OpenAlexaffabout
Maitreyi Raman, Lorian Taylor, Alana Schick, Christina Ohland, Kathy D. McCoy, Sandeep Kaur, Remo Panaccione, Raylene A. Reimer

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineCalprotectinUlcerative colitisRandomized controlled trialFaecal calprotectinBody mass indexMicrobiomeInflammatory bowel diseaseGastroenterologyPhysical therapyDiseaseBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background This study explored relationships between gut microbiome, faecal calprotectin (FCP) and an adapted Canadian healthy eating index (CHEI) in ulcerative colitis (UC) patients enrolled in a randomised controlled dietary intervention trial. Methods Patients with both active and quiescent disease were recruited from the Foothills Medical Center in Calgary, Alberta, Canada and randomised to either an 8-week reduced sulfur anti-inflammatory diet intervention (INT; n = 14) or conventional management control group (CM; n = 10). Each INT patient met with a registered dietitian for diet teaching, in person at baseline, over the phone at 2 weeks, and in person at 4 weeks. Stool samples and 24-h dietary recalls were collected at baseline and 8 weeks. DNA from stool samples was extracted and the V4 region of the 16S gene was sequenced. FCP was extracted and analyzed using the EK-CAL ELISA. An adapted CHEI was generated from diet recalls using previously validated scoring guidelines. Relationships between variables were analyzed using analysis of variance and chi-squared. Results Mean age of the sample was 36.3 (SD=8.7) and 58% were male. Baseline medications included aminosalicylates (71%), steroids (50%), biologics (33%), immunosuppressants (25%) and 21% of patients had taken antibiotics within the last 3 months. Α-diversity, or within-community diversity, significantly increased in the CM group and remained stable in the INT group over time (p = 0.005). Β-diversity, or between-community diversity appeared to increase in the intervention group over time (p < 0.01); however, this may have been influenced by antibiotic use in five patients. Significant differential features between the CM and INT groups (p < 0.01) at the genus level were identified in the phyla Firmicutes and Proteobacteria, specifically Catenibacterium, Parvimonas, Coprococcus_2 and Desulfovibrio. FCP appeared to be different between the groups (p = 0.05) with a greater percentage of INT patients moving from high FCP (>250 mg/g) to low FCP (<250 mg/g); 50% of INT patients and 20% of CM patients normalised FCP levels. As CHEI increased in the whole sample, indicating higher diet quality, FCP decreased significantly (p = 0.04). Conclusion In an interim analysis, a dietary intervention shows efficacy in manipulating the microbiome. Higher diet scores representing a healthier diet were also related to lower faecal calprotectin levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Essai randomisé · Signal consensuel: Essai randomisé
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,007
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeEssai randomisé
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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