Cytoplasmic factories, virus assembly, and DNA replication kinetics collectively constrain the formation of poxvirus recombinants
Notice bibliographique
Résumé
Poxviruses replicate in cytoplasmic structures called factories and each factory begins as a single infecting particle. Sixty-years ago Cairns predicted that this might have effects on vaccinia virus (VACV) recombination because the factories would have to collide and mix their contents to permit recombination. We've since shown that factories collide irregularly and that even then the viroplasm mixes poorly. We've also observed that while intragenic recombination occurs frequently early in infection, intergenic recombination is less efficient and happens late in infection. Something inhibits factory fusion and viroplasm mixing but what is unclear. To study this, we've used optical and electron microscopy to track factory movement in co-infected cells and correlate these observations with virus development and recombinant formation. While the technical complexity of the experiments limited the number of cells that are amenable to extensive statistical analysis, these studies do show that intergenic recombination coincides with virion assembly and when VACV replication has declined to ≤10% of earlier levels. Along the boundaries between colliding factories, one sees ER membrane remnants and other cell constituents like mitochondria. These collisions don't always cause factory fusion, but when factories do fuse, they still entrain cell constituents like mitochondria and ER-wrapped microtubules. However, these materials wouldn't seem to pose much of a further barrier to DNA mixing and so it's likely that the viroplasm also presents an omnipresent impediment to DNA mixing. Late packaging reactions might help to disrupt the viroplasm, but packaging would sequester the DNA just as the replication and recombination machinery goes into decline and further reduce recombinant yields. Many factors thus appear to conspire to limit recombination between co-infecting poxviruses.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».