MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2999528738 · doi:10.1038/s41598-019-57068-5

Metabolomics-Based Discovery of Molecular Signatures for Triple Negative Breast Cancer in Asian Female Population

2020· article· en· W2999528738 sur OpenAlexafffund
Lixian Li, Xiaodong Zheng, Qi Zhou, Nathaniel L. Villanueva, Weiqi Nian, Xingming Liu, Tao Huan

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesCancer Foundation of ChinaUniversity of British ColumbiaChongqing Science and Technology Commission
Mots-clésBreast cancerMetabolomicsPopulationComputational biologyCancerBiologyBioinformaticsOncologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Triple negative breast cancer (TNBC) is a devastating cancer disease characterized by its poor prognosis, distinct metastatic patterns, and aggressive biological behavior. Research indicates that the prevalence and presentation of TNBC varies among races, with Asian TNBC patients more commonly presenting with large invasive tumors, high node positivity, and high histologic grade. In this work, we applied ultra-high performance liquid chromatography-high resolution mass spectrometry (UHPLC-HRMS)-based metabolomics to discover metabolic signatures in Asian female TNBC patients. Serum samples from 31 TNBC patients and 31 healthy controls (CN) were involved in this study. A total of 2860 metabolic features were detected in the serum samples. Among them, 77 metabolites, whose levels were significantly different between TNBC with CN, were confirmed. Using multivariate statistical analysis, literature mining, metabolic network and pathway analysis, we performed an in-depth study of the metabolic alterations in the Asian TNBC population. In addition, we discovered a panel of metabolic signatures that are highly correlated with the 5-year survival rate of the TNBC patients. This metabolomic study provides a better understanding of the metabolic details of TNBC in the Asian population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,481

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetMetabolomics and Mass Spectrometry StudiesTravaux en français237 207