Microbial transformation of arsenic in Bengal floodplain
Notice bibliographique
Résumé
Methylation is an important biotransformation process that limits the toxicity of arsenic (As) in soil. Here we investigated how geomorphology and paddy management influences As speciation, and the abundance and diversity of the arsM gene responsible for bacterial methylation of arsenic. Soil samples collected from paddy and non-paddy fields of Holocene and Pleistocene regions of Bangladesh were incubated under anaerobic conditions to identify how these treatments affected As speciation in soil solution as well as to investigate the changes in relative arsM copy no and diversity in soil. The Holocene soil had higher concentration of soil solution arsenic species (inorganic arsenic, dimethylarsinic acid (DMA), trimethylarsenic oxide (TMAO), with qPCR showing higher copy numbers of both 16S and arsM in Holocene soil compared to Pleistocene soil. Lower soil Eh may explain the higher arsM copy number in Holocene soil, with arsenic methylation known to be increased under anaerobic conditions. The higher pH in Holocene soil may also explain the increase in 16S copy number, with bacteria known to be less abundant in acidic soils. Further to that amplicon sequencing showed an increased species richness (chao1) and diversity (Simpson) for both 16S and arsM in Holocene compare to Pleistocene soil. PiCrust analysis of the 16S amplicon results showed the presence of arsenic metabolism related genes some of which were increased in Holocene compared to Pleistocene soil. The results showed that presence of As soil chemistry strongly correlates with arsenic transformation and copy number of arsenic metabolizing genes and bacterial as well as arsM gene diversity.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».