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Enregistrement W3000070347 · doi:10.3390/microorganisms8010117

Subcellular Location of Piscirickettsia salmonis Heat Shock Protein 60 (Hsp60) Chaperone by Using Immunogold Labeling and Proteomic Analysis

2020· article· en· W3000070347 sur OpenAlexaff
Cristian Oliver, Patricio Sánchez, Mauricio Hernández, Juan Pablo Pontigo, M. Rauch, Rafael A. Garduño, Rubén Avendaño‐Herrera, Alejandro J. Yáñez

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensCanadian Food Inspection AgencyDalhousie University
Organismes subventionnairesFondo de Fomento al Desarrollo Científico y TecnológicoFondo de Financiamiento de Centros de Investigación en Áreas PrioritariasComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaUniversidad Austral de Chile
Mots-clésBiologyHSP60GroELImmunogold labellingHeat shock proteinSecretionChaperone (clinical)MicrobiologyCell envelopeType three secretion systemCytoplasmCell biologyHsp70VirulenceBiochemistryAntibodyEscherichia coliGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Piscirickettsia salmonis is the causative bacterial agent of piscirickettsiosis, a systemic fish disease that significantly impacts the Chilean salmon industry. This bacterium possesses a type IV secretion system (T4SS), several proteins of the type III secretion system (T3SS), and a single heat shock protein 60 (Hsp60/GroEL). It has been suggested that due to its high antigenicity, the P. salmonis Hsp60 could be surface-exposed, translocated across the membrane, and (or) secreted into the extracellular matrix. This study tests the hypothesis that P. salmonis Hsp60 could be located on the bacterial surface. Immunogold electron microscopy and proteomic analyses suggested that although P. salmonis Hsp60 was predominantly associated with the bacterial cell cytoplasm, Hsp60-positive spots also exist on the bacterial cell envelope. IgY antibodies against P. salmonis Hsp60 protected SHK-1 cells against infection. Several bioinformatics approaches were used to assess Hsp60 translocation by the T4SS, T3SS, and T6SS, with negative results. These data support the hypothesis that small amounts of Hsp60 must reach the bacterial cell surface in a manner probably not mediated by currently characterized secretion systems, and that they remain biologically active during P. salmonis infection, possibly mediating adherence and (or) invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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