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Enregistrement W3000102838 · doi:10.1002/1878-0261.12638

Upregulation of <i>BCAM</i> and its sense lncRNA <i>BAN</i> are associated with gastric cancer metastasis and poor prognosis

2020· article· en· W3000102838 sur OpenAlexaff
Juan Jin, Shanshan Xie, Qiang Sun, Huang Zhenxia, Kang‐Hua Chen, Dongyang Guo, Xianping Rao, Yujie Deng, Yiman Liu, Shuang Li, Wenyu Cui, Valentina Chanu Maibam, Junni Wang, Wei Zhuo, Tianhua Zhou

Notice bibliographique

RevueMolecular Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésDownregulation and upregulationGene knockdownMetastasisCell migrationLong non-coding RNABiologyCancer researchCancerCellCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with metastatic gastric cancer (GC) have a poor prognosis; however, the molecular mechanism of GC metastasis remains unclear. Here, we employed bioinformatics to systematically screen the metastasis-associated genes and found that the levels of basal cell adhesion molecule (BCAM) were significantly increased in GC tissues from patients with metastasis, as compared to those without metastasis. The upregulation of BCAM was also significantly associated with a shorter survival time. Depletion of BCAM inhibited GC cell migration and invasion. Knockout (KO) of BCAM by the CRISPR/Cas9 system reduced the invasion and metastasis of GC cells. To explore the mechanism of BCAM upregulation, we identified a previously uncharacterized BCAM sense lncRNA that spanned from exon 6 to intron 6 of BCAM, and named it as BCAM-associated long noncoding RNA (BAN). Knockdown of BAN inhibited BCAM expression at both mRNA and protein levels. Knockdown of BAN suppressed GC cell migration and invasion, which was effectively rescued by ectopic expression of BCAM. Further clinical data showed that BAN upregulation was associated with GC metastasis and poor prognosis. Importantly, BAN expression was also significantly associated with that of BCAM in GC tissues. Taken together, these results indicate that increased expression of BCAM and its sense lncRNA BAN promote GC cell invasion and metastasis, and are associated with poor prognosis of GC patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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