Survival-Associated Metabolic Genes in Human Papillomavirus-Positive Head and Neck Cancers
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Human papillomavirus (HPV) causes an increasing number of head and neck squamous cell carcinomas (HNSCCs). Altered metabolism contributes to patient prognosis, but the impact of HPV status on HNSCC metabolism remains relatively uncharacterized. We hypothesize that metabolism-related gene expression differences unique to HPV-positive HNSCC influences patient survival. The Cancer Genome Atlas RNA-seq data from primary HNSCC patient samples were categorized as 73 HPV-positive, 442 HPV-negative, and 43 normal-adjacent control tissues. We analyzed 229 metabolic genes and identified numerous differentially expressed genes between HPV-positive and negative HNSCC patients. HPV-positive carcinomas exhibited lower expression levels of genes involved in glycolysis and higher levels of genes involved in the tricarboxylic acid cycle, oxidative phosphorylation, and β-oxidation than the HPV-negative carcinomas. Importantly, reduced expression of the metabolism-related genes SDHC, COX7A1, COX16, COX17, ELOVL6, GOT2, and SLC16A2 were correlated with improved patient survival only in the HPV-positive group. This work suggests that specific transcriptional alterations in metabolic genes may serve as predictive biomarkers of patient outcome and identifies potential targets for novel therapeutic intervention in HPV-positive head and neck cancers.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle