MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3000276762 · doi:10.3390/microorganisms8010138

Characterization of ESBL-Producing Enterobacteria from Fruit Bats in an Unprotected Area of Makokou, Gabon

2020· article· en· W3000276762 sur OpenAlexfundno aff
Pierre Philippe Mbehang Nguema, Richard Onanga, Guy Roger Ndong Atome, Jean Constant Obague Mbeang, Arsène Mabika Mabika, Moussa Yaro, Manon Lounnas, Yann Dumont, Zaidi Fatma Zohra, Sylvain Godreuil, François Bretagnolle

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgence Universitaire de la Francophonie
Mots-clésEnterobacter cloacaeKlebsiella pneumoniaeBiologyMicrobiologyEnterobacteriaceaeAntibiotic resistanceBacteriaEscherichia coliAntibioticsIsolation (microbiology)EnterobacterGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Gabon, terrestrial mammals of protected areas have been identified as a possible source of antibiotic-resistant bacteria. Some studies on antibiotic resistance in bats have already been carried out. The main goal of our study was to detect extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) that are produced by enterobacteria from bats in the Makokou region in Gabon. Sixty-eight fecal samples were obtained from 68 bats caught in the forests located 1 km from the little town of Makokou. After culture and isolation, 66 Gram-negative bacterial colonies were obtained. The double-disk diffusion test confirmed the presence of ESBLs in six (20.69%) Escherichia coli isolates, four (13.79%) Klebsiella pneumoniae isolates, and one (3.45%) Enterobacter cloacae isolate. The analysis based on the nucleotide sequences of the ESBL resistance genes showed that all cefotaximase-Munichs (CTX-Ms) were CTX-M-15 and that all sulfhydryl variables (SHVs) were SHV-11: 54.54% ESBL (CTX-M-15)-producing E. coli, 9.09% ESBL (CTX-M-15)-producing K. pneumoniae, 27.27% ESBL (CTX-M-15, SHV-11)-producing K. pneumoniae, and 9.09% ESBL (CTX-M-15)-producing E. cloacae. This study shows for the first time the presence of multiresistant ESBL-producing enterobacteria in fruit bats in Makokou.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicroorganismsMême sujetAntibiotic Resistance in BacteriaTravaux en français237 207