Usefulness and limitations of mRNA measurement in HepaRG cells for evaluation of cytochrome P450 induction
Notice bibliographique
Résumé
Cytochrome P450s (CYPs) are involved in the metabolism of various drugs, and may generate toxic metabolites or intermediates that result in drug-induced liver injury (DILI). Consequently, inducers of CYPs may promote DILI. In a draft test guideline, the Organisation for Economic Co-operation and Development (OECD) recommends measurement of the metabolic activity of CYP as an index for assessing CYP-inducing activity. However, change of mRNA level has also been used as a simple parameter to evaluate CYP induction. In this study, therefore, we examined the usefulness and limitations of mRNA expression measurement for evaluation of the induction of CYP1A2, CYP2B6, and CYP3A4 by omeprazole, phenobarbital, and rifampicin (RIF), respectively, in HepaRG cells, a well-established cell line derived from human hepatocellular carcinoma. The results of mRNA measurement correlated well with the results of metabolic activity measurement in the lower concentration ranges for all inducers, even though we observed significant decreases in albumin and urea secretion in the presence of 10 µM RIF, reflecting its known hepatotoxicity. Our results indicate that mRNA measurements and metabolic activity measurements in HepaRG cells generally give comparable results for fold-induction of CYPs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».