MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3000442445 · doi:10.1002/ajpa.24008

Morphoscopic ancestry estimates in Filipino crania using multivariate probit regression models

2020· article· en· W3000442445 sur OpenAlexfundno aff
Matthew C. Go, Joseph T. Hefner

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physical Anthropology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueForensic Anthropology and Bioarchaeology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of JusticeSocial Sciences and Humanities Research Council of Canada
Mots-clésCraniaMultivariate statisticsProbit modelProbitPopulationStatisticsDemographyMultivariate analysisSample (material)Multivariate probit modelLogistic regressionOrdered probitGeographyMathematicsSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Probit has not been applied to ancestry estimation in forensic anthropology. The goals of this study were to: (1) evaluate the performance of probit analysis as a classification tool for ancestry estimation using ordinal data and (2) expand our current understanding of human cranial variation for an understudied population. METHODS: Multivariate probit models were used to classify the ancestral affiliation of Filipino crania using morphoscopic traits. Ancestral reference populations represented Africa, Asia, and Europe in a three-group model, with the addition of Hispanics in a four-group model. Posterior probabilities across these groups were interpreted as admixture proportions of an individual. Model performance was also evaluated for individuals with missing data. RESULTS: The overall correct classification rates for the three-group and four-group models were 72.1% and 68.6%, respectively. Filipinos classified as Asian 52.9% of the time using three ancestral reference groups and 48.6% using four groups. A large portion of Filipinos also classified as African. There were no significant differences in classification trends or accuracy rates between complete crania and crania with at least one missing variable. CONCLUSIONS: Multivariate probit models using morphoscopic traits perform well when populations are represented in both training and test samples. Probit can also accommodate individuals with missing data. Classifying Filipinos showed only moderate success. Filipinos are more phenotypically similar to Africans than the other Asian samples used here, but still affiliate most closely as Asian. Ancestry methods would benefit from including Filipinos as a reference sample given the additional variation they provide to the continental category of Asian.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,459
Score d'incertitude au seuil0,972

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,031
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeQualitatif
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Physical AnthropologyMême sujetForensic Anthropology and Bioarchaeology StudiesTravaux en français237 207