MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3000502358 · doi:10.1111/cea.13568

A thymic stromal lymphopoietin polymorphism may provide protection from asthma by altering gene expression

2020· article· en· W3000502358 sur OpenAlexafffund
Amy Moorehead, Raphael Hanna, Delia Heroux, Helen Neighbour, Andrew J. Sandford, Gail M. Gauvreau, Doron D. Sommer, Judah A. Denburg, Loubna Akhabir

Notice bibliographique

RevueClinical & Experimental Allergy · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDermatology and Skin Diseases
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcMaster University
Organismes subventionnairesAllerGen
Mots-clésThymic stromal lymphopoietinAsthmaImmunologyPolymorphism (computer science)MedicineStromal cellGene expressionGeneBiologyGeneticsCancer researchAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genome-wide association studies have identified associations of the single nucleotide polymorphism rs1837253 in the thymic stromal lymphopoietin (TSLP) gene with asthma, allergic disease and eosinophilia. The TSLP gene encodes two isoforms, long and short, and previous studies have indicated functional differences between these two isoforms. OBJECTIVE: We investigated the expression of these TSLP isoforms in response to a pro-inflammatory signal, and the role of the rs1837253 genotype in gene isoform regulation. METHODS: We cultured nasal epithelial cells of asthmatic and non-asthmatic subjects and evaluated poly(I:C)-induced TSLP protein secretion using multiplex protein assays and gene expression profiles of the TSLP isoforms, and related genes using real-time qPCR. We correlated these profiles with rs1837253 genotype. RESULTS: Asthmatic nasal epithelial cells exhibited increased TSLP protein secretion compared with nasal epithelial cells from healthy controls. The long TSLP isoform was more responsive to poly(I:C) stimulation. Additionally, the minor T allele of rs1837253 was less inducible than the major C allele, suggesting differential regulation; this may explain the "protective" effects of the T allele in asthma. CONCLUSION: Our results provide important insights into the differential regulation and function of TSLP isoforms, including the role of TSLP rs1837253 polymorphisms in allergic inflammatory processes. CLINICAL RELEVANCE: The key finding on the influence of TSLP genetic variation on disease expression/endotype could provide basis for investigation into targeted biologics for anti-TSLP therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical & Experimental AllergyMême sujetDermatology and Skin DiseasesTravaux en français237 207