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Enregistrement W3000557494 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjz203.267

P138 Basal plasma cells in normal large bowel: what is normal?

2020· article· en· W3000557494 sur OpenAlexaffabout
M. Paola Castelli, Dua Abuquteish, Mirko Di Ruscio, Gianluigi Lunardi, Giuseppe Zamboni, Robert H. Riddell

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRectumCecumBasal (medicine)ColonoscopyLamina propriaMedicineGastroenterologyInflammatory bowel diseaseInternal medicineColorectal cancerPathologyCancerEpitheliumDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Basal plasma cells (BPC) are a diagnostic criterion for inflammatory bowel disease (IBD) and their persistence following therapy also indicates an increased risk of relapse. However neither the definition of basal plasma cells nor what is normal has been well established. We examined these parameters and determined whether there is reginal variability throughout the large bowel. Methods We looked at two patient populations. Group A) Biopsies from 6 standardised sites around the colon (cecum to rectum) from 37 patients who had normal colonoscopy at IRCCS Sacro Cuore Hospital, Negrar, Verona, Italy for symptoms suggesting irritable bowel syndrome, who were free of all medical therapy. Group B) a validation cohort from Mt Sinai Hospital Toronto using sections from the same 6 sites from 16 subtotal and total colectomy specimens performed for non-obstructing colonic carcinoma, primarily Lynch syndrome. Basal plasma cells were counted between two crypts in both the basal 5%, and the basal 20% of the mucosa. A partitioned visual analogue scale (PVAS) was also developed to see if this could replace counting, especially as the distance between crypts in IBD is variable Results In group A, in the lowest 5% part of the lamina propria, basal plasma cells were found throughout the large bowel and were highest in the proximal colon and lowest in the rectosigmoid. The maximum number of plasma cells between crypts was seven for the cecum and two for the rectum, with a gentle gradation between these two. The PVAS (range 1–5) varied from a maximum of 2 proximally to 1 distally. When the basal 20% was counted, the scores ranged from 35 in the cecum to 12 in the rectum, again with a gradation between, but the PVAS increased from a maximum of 3 proximally to 2 in the rectum. In group B the results were virtually to Group A and the PVAS scores were also virtually identical, The main difference was that at least one plasma cell was seen in all sections, likely because tissue sections encompass a much larger area. These results were all statistically significant. Conclusion The normal large bowel has a gradation of plasma cells that is highest proximally and lowest distally, however assessed, and needs to be taken into account when assessing the presence of basal plasma cells as an indicator of increased likelihood of relapse of IBD. The PVAS developed can replace the chore of counting, and is likely more meaningful when architectural distortion is present.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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