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Enregistrement W3000726111 · doi:10.1093/cid/ciaa002

Prevalence and Incidence of Human Papillomavirus Infection in Men Having Sex With Men Enrolled in a Pre-exposure Prophylaxis Study: A Sub-study of the Agence Nationale de Recherches sur le SIDA et les Hépatites Virales “Intervention Préventive de l’Exposition aux Risques avec et pour les hommes Gays” Trial

2020· article· en· W3000726111 sur OpenAlexaff
Laurent Cotte, David Veyer, Isabelle Charreau, Hélène Péré, Éric Cua, Diane Carette, Julie Chas, Catherine Capitant, Christian Chidiac, Jean–François Fléjou, S. Fouéré, Isabelle Heard, Laurence Meyer, Julien Puech, Cécile Tremblay, Constance Delaugerre, Jean‐Michel Molina

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésMedicineMen who have sex with menIncidence (geometry)Anal cancerGynecologyHuman papillomavirusGenotypingGenotypeAnal sexHPV infectionHuman immunodeficiency virus (HIV)Internal medicineVirologyCervical cancerCancerSyphilisBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human papillomavirus (HPV) infection is more frequent in men having sex with men (MSM) who are living with human immunodeficiency virus (HIV) than in MSM without HIV. There are currently no data regarding HPV infections in preexposure prophylaxis (PrEP)-using MSM. METHODS: MSM living without HIV who were enrolled in the Agence Nationale de Recherches sur le SIDA et les Hépatites Virales "Intervention Préventive de l'Exposition aux Risques avec et pour les hommes Gays" PrEP study were prospectively enrolled. Anal, penile, and oral samples were collected at baseline and every 6 months for HPV detection and genotyping. Anal swabs for cytology were obtained at baseline and at 24 months. RESULTS: We enrolled 162 participants. The prevalences of any HPV genotypes at baseline were 92%, 32%, and 12% at the anal, penile, and oral sites, respectively. High-risk (HR) HPV genotypes were observed in 84%, 25%, and 10% of anal, penile, and oral baseline samples, respectively. Nonavalent HPV vaccine genotypes were observed in 77%, 22%, and 6% of anal, penile, and oral baseline samples, respectively. Multiple infections were observed in 76%, 17%, and 3% of cases at the anal, penile, and oral sites, respectively. The most frequent HR genotypes were HPV 53, 51, and 16 in anal samples; HPV 33, 39, and 73 in penile samples; and HPV 66 in oral samples. The incidence of any HPV genotype at the anal site was 86.2/1000 person-months and the incidence of HR-HPV genotypes was 72.3/1000 person-months. The baseline cytology was normal in 32% of cases and was classified as atypical squamous cells of undetermined significance, low-grade squamous intra-epithelial lesion, high-grade squamous intra-epithelial lesion (HSIL), and atypical squamous cells that cannot exclude HSIL in 23%, 40%, 5%, and 1% of cases, respectively. CONCLUSIONS: PrEP users have a similar risk of HPV infection as MSM living with HIV and the risk is much higher than that previously reported in MSM living without HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,107
Tête enseignante GPT0,428
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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