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Enregistrement W3001144267 · doi:10.1002/bies.201900132

The Interchromatin Compartment Participates in the Structural and Functional Organization of the Cell Nucleus

2020· review· en· W3001144267 sur OpenAlexafffund
Thomas Cremer, Marion Cremer, Barbara Hübner, Asli Silahtaroglu, Michael J. Hendzel, Christian Lanctôt, Hilmar Strickfaden, Christoph Cremer

Notice bibliographique

RevueBioEssays · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensCollège ShawiniganUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésEuchromatinCompartment (ship)Cell biologyRNA splicingCell nucleusNucleusNuclear transportCajal bodyBiologyHeterochromatinTranscription (linguistics)Nuclear poreHeterogeneous ribonucleoprotein particleRibonucleoproteinTranscription factorTranscription factoriesNuclear export signalPrecursor mRNANuclear proteinChromatinGeneRNAGeneticsTranscriptional regulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This article focuses on the role of the interchromatin compartment (IC) in shaping nuclear landscapes. The IC is connected with nuclear pore complexes (NPCs) and harbors splicing speckles and nuclear bodies. It is postulated that the IC provides routes for imported transcription factors to target sites, for export routes of mRNA as ribonucleoproteins toward NPCs, as well as for the intranuclear passage of regulatory RNAs from sites of transcription to remote functional sites (IC hypothesis). IC channels are lined by less-compacted euchromatin, called the perichromatin region (PR). The PR and IC together form the active nuclear compartment (ANC). The ANC is co-aligned with the inactive nuclear compartment (INC), comprising more compacted heterochromatin. It is postulated that the INC is accessible for individual transcription factors, but inaccessible for larger macromolecular aggregates (limited accessibility hypothesis). This functional nuclear organization depends on still unexplored movements of genes and regulatory sequences between the two compartments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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