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Enregistrement W3001509417 · doi:10.1139/cjm-2019-0493

FtsA G50E mutant suppresses the essential requirement for FtsK during bacterial cell division in <i>Escherichia coli</i>

2020· article· en· W3001509417 sur OpenAlexaffvenue
Alison Berezuk, Elyse J. Roach, Laura Seidel, Reggie Y.C. Lo, Cezar M. Khursigara

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliMutantCell divisionBiologyMicrobiologyBacteriaEscherichia coli ProteinsDivision (mathematics)Cell biologyCellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Escherichia coli, the N-terminal domain of the essential protein FtsK (FtsKN) is proposed to modulate septum formation through the formation of dynamic and essential protein interactions with both the Z-ring and late-stage division machinery. Using genomic mutagenesis, complementation analysis, and in vitro pull-down assays, we aimed to identify protein interaction partners of FtsK essential to its function during division. Here, we identified the cytoplasmic Z-ring membrane anchoring protein FtsA as a direct protein–protein interaction partner of FtsK. Random genomic mutagenesis of an ftsK temperature-sensitive strain of E. coli revealed an FtsA point mutation (G50E) that is able to fully restore normal cell growth and morphology, and further targeted site-directed mutagenesis of FtsA revealed several other point mutations capable of fully suppressing the essential requirement for functional FtsK. Together, this provides insight into a potential novel co-complex formed between these components during division and suggests FtsA may directly impact FtsK function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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