MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3001589923 · doi:10.3399/bjgpopen20x101006

The feasibility of measuring calprotectin from a throat swab as a marker of infections caused by group A streptococcus: a case–control feasibility study

2020· article· en· W3001589923 sur OpenAlexaff
Behnaz Schofield, Clive Gregory, Micaela Gal, David Gillespie, Gurudutt Naik, Alastair D Hay, Nick Francis

Notice bibliographique

RevueBJGP Open · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care ResearchCardiff UniversityUnited Kingdom Clinical Research Collaboration
Mots-clésSore throatMedicineThroatCalprotectinPharyngitisInternal medicineStreptococcusThroat cultureAntibioticsSurgeryMicrobiologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Most people with sore throat do not benefit from antibiotic treatment, but nearly three-quarters of those presenting in primary care are prescribed antibiotics. A test that is predictive of bacterial infection could help guide antibiotic prescribing. Calprotectin is a biomarker of neutrophilic inflammation, and may be a useful marker of bacterial throat infections. AIM: To assess the feasibility of measuring calprotectin from throat swabs, and assess whether individuals with sore throats likely to be caused by streptococcal infections have apparently higher throat calprotectin levels than other individuals with sore throat and healthy volunteers. DESIGN & SETTING: A proof of concept case-control study was undertaken, which compared primary care patients with sore throats and healthy volunteers. METHOD: Baseline characteristics and throat swabs were collected from 30 primary care patients with suspected streptococcal sore throat, and throat swabs were taken from 10 volunteers without sore throat. Calprotectin level determination and rapid antigen streptococcal testing were conducted on the throat swab eluents. Calprotectin levels in the following groups were compared: volunteers without a sore throat; all patients with a sore throat; patients with a sore throat testing either negative or positive for streptococcal antigen; and those with lower and higher scores on clinical prediction rules for streptococcal sore throat. RESULTS: Calprotectin was detected in all throat swab samples. Mean calprotectin levels were numerically higher in patients with sore throat compared with healthy volunteers, and sore throat patients who had group A streptococci antigen detected compared with those who did not. CONCLUSION: Calprotectin can be measured from throat swab samples and levels are consistent with the hypothesis that streptococcal infection leads to higher throat calprotectin levels. This hypothesis will be tested in a larger study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,038
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,114

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,038
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBJGP OpenMême sujetS100 Proteins and AnnexinsTravaux en français237 207