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Enregistrement W3002302035 · doi:10.1093/ckj/sfz184

Diagnostic accuracy of administrative codes for autosomal dominant polycystic kidney disease in clinic patients with cystic kidney disease

2019· article· en· W3002302035 sur OpenAlexafffundabout
Vinusha Kalatharan, Eric McArthur, Danielle M. Nash, Blayne Welk, Sisira Sarma, Amit X. Garg, York Pei

Notice bibliographique

RevueClinical Kidney Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkWestern University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Health and Long-Term CareKidney Foundation of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Society of Nephrology
Mots-clésAutosomal dominant polycystic kidney diseasePolycystic kidney diseaseMedicineDiseaseKidney diseaseCystic kidney diseaseKidneyDiagnosis codePolycystic kidneyInternal medicineIntensive care medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The ability to identify patients with autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) and distinguish them from patients with similar conditions in healthcare administrative databases is uncertain. We aimed to measure the sensitivity and specificity of different ADPKD administrative coding algorithms in a clinic population with non-ADPKD and ADPKD kidney cystic disease. METHODS: We used a dataset of all patients who attended a hereditary kidney disease clinic in Toronto, Ontario, Canada between 1 January 2010 and 23 December 2014. This dataset included patients who met our reference standard definition of ADPKD or other cystic kidney disease. We linked this dataset to healthcare databases in Ontario. We developed eight algorithms to identify ADPKD using the International Classification of Diseases, 10th Revision (ICD-10) codes and provincial diagnostic billing codes. A patient was considered algorithm positive if any one of the codes in the algorithm appeared at least once between 1 April 2002 and 31 March 2015. RESULTS: The ICD-10 coding algorithm had a sensitivity of 33.7% [95% confidence interval (CI) 30.0-37.7] and a specificity of 86.2% (95% CI 75.7-92.5) for the identification of ADPKD. The provincial diagnostic billing code had a sensitivity of 91.1% (95% CI 88.5-93.1) and a specificity of 10.8% (95% CI 5.3-20.6). CONCLUSIONS: ICD-10 coding may be useful to identify patients with a high chance of having ADPKD but fail to identify many patients with ADPKD. Provincial diagnosis billing codes identified most patients with ADPKD and also with other types of cystic kidney disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,065
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,065
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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