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Enregistrement W3002597129 · doi:10.24911/jbcgenetics/183-1563341940

Analysis of tricarboxylic acid cycle intermediates in dried blood spots by ultraperformance liquid chromatography-tandem mass spectrometry

2019· article· en· W3002597129 sur OpenAlexaff
Lamia Dirbashi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biochemical and Clinical Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal and reproductive studies
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatographySpotsChemistryTandem mass spectrometryMass spectrometryTricarboxylic acidDried bloodTandemCitric acid cycleBiochemistryMaterials scienceMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: We developed a novel method for measuring the concentrations of tricarboxylic acid (TCA) cycle intermediates in dried blood spots (DBS) using liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/ MS). Analytes were derivatized before analysis using 4-[2-(N,N-dimethylamino) ethylaminosulfonyl]-7-(2-aminoethylamino)-2,1,3-benzoxa-diazole (DAABD-AE), a reagent that imparts powerful chromatographic and mass spectrometric properties onto carboxyl group-containing analytes. Methodology: Extraction and derivatization of TCA cycle intermediates were achieved in a single step by incubating a 3.2 mm circle of the DBS samples with DAABD-AE for 1 hour at 65 C. From the resultant mixture, 1.0 µl was injected into the LC-MS/MS. Results: Total analytical run time to separate target analytes from other interfering components in the sample was 8 minutes. The peaks corresponding to malic, fumaric, citric, succinic, and 2-ketoglutaric acid appeared at 3.55, 3.62, 3.64, 3.67, and 3.68 minutes, respectively. The method was adequately reproducible with a coefficient of variation for intraday (n = 15) and inter-day (n = 13) studies of 5.2%-18.4%. Reference intervals in DBS from controls (n = 125) were as follow (µmol/l): citric (36.6-126.4), 2-ketoglutaric (9.1-42.1), succinic (1.2-2.4), fumaric (2.4-9.0), and malic acid (15.9-39.3). Compared to controls, the levels of citric, succinic, and malic acids were statistically different in patients (n = 7) with a p-value of< 0.05. No statistically significant difference was detected in concentrations of 2-ketoglutaric and fumaric acids. Conclusion: We describe a simple, quick, and sensitive method to measure TCA cycle intermediates in DBS samples. That TCA cycle plays a central role in cellular metabolism; this method should be useful in studying these metabolites in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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