MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3002674720 · doi:10.1155/2020/8958192

Seroprevalence of Human Betaretrovirus Surface Protein Antibodies in Patients with Breast Cancer and Liver Disease

2020· article· en· W3002674720 sur OpenAlexafffund
Guangzhi Zhang, Kiandokht Bashiri, Mark Kneteman, Kevan Cave, Youngkee Hong, John R. Mackey, Harvey J. Alter, Andrew L. Mason

Notice bibliographique

RevueJournal of Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesCanadian Liver FoundationAlberta Cancer Foundation
Mots-clésSerologyMedicineBreast cancerSeroprevalenceCancerAntibodyHepatitis B virusVirusDiseaseImmunologyInternal medicineVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mouse mammary tumor virus (MMTV) is a betaretrovirus that plays a causal role in the development of breast cancer and lymphoma in mice. Closely related sequences that share 91–99% nucleotide identity with MMTV have been repeatedly found in humans with neoplastic and inflammatory diseases. Evidence for infection with a betaretrovirus has been found in patients with breast cancer and primary biliary cholangitis and referred to as the human mammary tumor virus and the human betaretrovirus (HBRV), respectively. Using the gold standard technique of demonstrating retroviral infection, HBRV proviral integrations have been detected in cholangiocytes, lymph nodes, and liver of patients with primary biliary cholangitis. However, the scientific biomedical community has not embraced the hypothesis that MMTV like betaretroviruses may infect humans because reports of viral detection have been inconsistent and robust diagnostic assays are lacking. Specifically, prior serological assays using MMTV proteins have produced divergent results in human disease. Accordingly, a partial HBRV surface (Su) construct was transfected into HEK293 to create an ELISA. The secreted HBRV gp52 Su protein was then used to screen for serological responses in patients with breast cancer and liver disease. A greater proportion of breast cancer patients ( n = 98) were found to have serological reactivity to HBRV Su as compared to age- and sex-matched control subjects (10.2% versus 2.0%, P = 0.017 , OR = 5.6 [1.25–26.3]). Similarly, the frequency of HBRV Su reactivity was higher in patients with primary biliary cholangitis ( n = 156) as compared to blood donors (11.5% vs. 3.1%, P = 0.0024 , OR = 4.09 [1.66–10.1]). While the sensitivity of the HBRV Su ELISA was limited, the assay was highly specific for serologic detection in patients with breast cancer or primary biliary cholangitis, respectively (98.0% [93.1%–99.7%] and 97.0% [93.4%–98.6%]). Additional assays will be required to link immune response to betaretrovirus infection and either breast cancer or primary biliary cholangitis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of OncologyMême sujetHepatitis B Virus StudiesTravaux en français237 207