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Enregistrement W3003089385 · doi:10.1002/aqc.3270

Phylogeography, genetic stocks, and conservation implications for an Australian endemic marine turtle

2020· article· en· W3003089385 sur OpenAlexaff
Nancy N. FitzSimmons, Stewart D. Pittard, Nathan McIntyre, Michael P. Jensen, Mick Guinea, Mark Hamann, Rod Kennett, Brett Leis, Colin J. Limpus, Duncan J. Limpus, Megan J. McCann, Anna J. MacDonald, Glenn McFarlane, C. John Parmenter, Kellie Pendoley, Robert T. Prince, Leigh Scheltinga, Kathrin Theißinger, Anton D. Tucker, David Waayers, Andrea U. Whiting, Scott D. Whiting

Notice bibliographique

RevueAquatic Conservation Marine and Freshwater Ecosystems · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueTurtle Biology and Conservation
Établissements canadiensFraser Health
Organismes subventionnairesUniversity of CanberraInstitute for Applied Ecology
Mots-clésPhylogeographyEndemismEcologyGeographyTurtle (robot)BiologyFisheryPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Identification of the geographic extent of population boundaries, the distribution of genetic lineages, and the amount of genetic exchange among breeding groups is needed for effective conservation of vulnerable marine migratory species. This is particularly true of the flatback turtle ( Natator depressus ), which only breeds in Australia but has extensive migrations that can include international waters. This study investigated the phylogeography and genetic structure among 17 flatback turtle rookeries across their range by sequencing an 810 bp portion of the mitochondrial DNA in 889 samples and genotyping 10 microsatellite loci in 598 samples. There was low phylogenetic divergence among haplotypes and evidence of recent population expansion, likely in the late Pleistocene. A predominant haplotype was found across all rookeries, but other haplotype groups were regionally specific. In general, there was agreement in patterns of genetic differentiation in the mitochondrial DNA and microsatellite data, and in some pairwise comparisons a higher mutation rate of microsatellites provided stronger evidence of differentiation. These results suggest natal philopatry operates in the choice of breeding locations for males as well as females. Evidence of genetic connectivity among neighbouring rookeries led to the identification of seven genetic stocks. Geographic boundaries of rookeries used by genetic stocks varied widely (160–1,300 km), highlighting a need for field studies to better understand movement patterns. Hierarchical analysis of molecular variance identified significant genetic differentiation based upon genetic stock, nesting phenology (summer vs. winter nesters), and a west–east discontinuity across Torres Strait. A pattern of isolation by distance was identified, which was most strongly observed in the microsatellite data. In combination with tagging and telemetry studies, these results will allow better quantification of stock‐specific threats along migratory routes and in foraging habitats. Implications of climate change will be stock specific and may depend upon the extent of genetic connectivity between neighbouring stocks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,207
Score d'incertitude au seuil0,988

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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