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Enregistrement W3003101200 · doi:10.1016/j.neuroimage.2020.116551

Myelin water imaging data analysis in less than one minute

2020· article· en· W3003101200 sur OpenAlexafffund
Hanwen Liu, Qing‐San Xiang, Roger Tam, Adam Dvorak, Alex L. MacKay, Shannon Kolind, Anthony Traboulsee, Irene M. Vavasour, David K.B. Li, John K. G. Kramer, Cornelia Laule

Notice bibliographique

RevueNeuroImage · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaInternational Collaboration On Repair Discoveries
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMultiple Sclerosis Society of Canada
Mots-clésVoxelPattern recognition (psychology)MyelinArtificial intelligenceWhite matterNeuroimagingArtificial neural networkScannerComputer scienceMagnetic resonance imagingNeurosciencePsychologyCentral nervous systemMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Based on a deep learning neural network (NN) algorithm, a super fast and easy to implement data analysis method was proposed for myelin water imaging (MWI) to calculate the myelin water fraction (MWF). A NN was constructed and trained on MWI data acquired by a 32-echo 3D gradient and spin echo (GRASE) sequence. Ground truth labels were created by regularized non-negative least squares (NNLS) with stimulated echo corrections. Voxel-wise GRASE data from 5 brains (4 healthy, 1 multiple sclerosis (MS)) were used for NN training. The trained NN was tested on 2 healthy brains, 1 MS brain with segmented lesions, 1 healthy spinal cord, and 1 healthy brain acquired from a different scanner. Production of whole brain MWF maps in approximately 33 ​s can be achieved by a trained NN without graphics card acceleration. For all testing regions, no visual differences between NN and NNLS MWF maps were observed, and no obvious regional biases were found. Quantitatively, all voxels exhibited excellent agreement between NN and NNLS (all R2>0.98, p ​< ​0.001, mean absolute error <0.01). The time for accurate MWF calculation can be dramatically reduced to less than 1 ​min by the proposed NN, addressing one of the barriers facing future clinical feasibility of MWI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,619
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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