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Enregistrement W3003282661 · doi:10.1101/2020.01.31.929026

Single-molecule imaging of telomerase RNA reveals a Recruitment – Retention model for telomere elongation

2020· preprint· en· W3003282661 sur OpenAlexafffund
Hadrien Laprade, Emmanuelle Querido, Michael J. Smith, David Guérit, Hannah Crimmins, Dimitri Conomos, E. Pourret, Pascal Chartrand, Agnel Sfeir

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteSchool of Medicine, New York UniversityNational Institutes of Health
Mots-clésTelomereTelomeraseRNATelomerase RNA componentCell biologyBiologyTelomerase reverse transcriptaseComputational biologyGeneticsDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Extension of telomeres is a critical step in the immortalization of cancer cells. This complex reaction requires proper spatio-temporal coordination of telomerase and telomeres, and remains poorly understood at the cellular level. To understand how cancer cells execute this process, we combined CRISPR genome editing and MS2 RNA-tagging to image single-molecules of telomerase RNA (hTR). Real-time dynamics and photoactivation experiments of hTR in Cajal bodies (CBs) reveal that hTERT controls the exit of hTR from CBs. Single-molecule tracking of hTR at telomeres shows that TPP1-mediated recruitment results in short telomere-telomerase scanning interactions, then base-pairing between hTR and telomere ssDNA promotes long interactions required for stable telomerase retention. Interestingly, POT1 OB-fold mutations that result in abnormally long telomeres in cancers act by enhancing this retention step. In summary, single-molecule imaging unveils the life-cycle of telomerase RNA and provides a framework to understand how cancer-associated mutations mechanistically drive defects in telomere homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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