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Enregistrement W3003448798 · doi:10.1016/j.bpsc.2020.01.004

Fully Automated Habenula Segmentation Provides Robust and Reliable Volume Estimation Across Large Magnetic Resonance Imaging Datasets, Suggesting Intriguing Developmental Trajectories in Psychiatric Disease

2020· article· en· W3003448798 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiological Psychiatry Cognitive Neuroscience and Neuroimaging · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensSunnybrook HospitalMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteUniversity Health Network
Organismes subventionnairesGeneral Armaments Department, People's Liberation ArmyFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionWellcome TrustFondation Brain CanadaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCompute CanadaHealth CanadaBrain and Behavior Research Foundation
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)SegmentationBipolar disorderMagnetic resonance imagingHabenulaReliability (semiconductor)NeuroimagingComputer scienceArtificial intelligenceNeurosciencePsychologyMedicinePsychiatryRadiologyCognitionPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies of habenula (Hb) function and structure provided evidence of its involvement in psychiatric disorders, including schizophrenia and bipolar disorder. Previous studies using magnetic resonance imaging (manual/semiautomated segmentation) have reported conflicting results. Aiming to improve Hb segmentation reliability and the study of large datasets, we describe a fully automated protocol that was validated against manual segmentations and applied to 3 datasets (childhood/adolescence and adult bipolar disorder and schizophrenia). It achieved reliable Hb segmentation, providing robust volume estimations across a large age range and varying image acquisition parameters. Applying it to clinically relevant datasets, we found smaller Hb volumes in the adult bipolar disorder dataset and larger volumes in the adult schizophrenia dataset compared with healthy control subjects. There are indications that Hb volume in both groups shows deviating developmental trajectories early in life. This technique sets a precedent for future studies, as it allows for fast and reliable Hb segmentation and will be publicly available.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,162
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle