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Enregistrement W3003667353 · doi:10.1002/sim.8468

A fair comparison of tree‐based and parametric methods in multiple imputation by chained equations

2020· article· en· W3003667353 sur OpenAlexfundno aff
Emily Slade, Melissa Naylor

Notice bibliographique

RevueStatistics in Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Bayesian Inference
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNorman Cousins Center for PsychoneuroimmunologyNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SServierNational Institute of Environmental Health SciencesNorthern California Institute for Research and EducationAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeGE HealthcareAlzheimer's AssociationFujirebio USPfizerBioClinicaBiogenNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbRocheMerckAlzheimer's Drug Discovery FoundationTakeda Pharmaceutical CompanyAbbVieFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésImputation (statistics)Parametric statisticsComputer scienceNonparametric statisticsInferenceMissing dataStatisticsEconometricsData miningMathematicsMachine learningArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple imputation by chained equations (MICE) has emerged as a leading strategy for imputing missing epidemiological data due to its ease of implementation and ability to maintain unbiased effect estimates and valid inference. Within the MICE algorithm, imputation can be performed using a variety of parametric or nonparametric methods. Literature has suggested that nonparametric tree-based imputation methods outperform parametric methods in terms of bias and coverage when there are interactions or other nonlinear effects among the variables. However, these studies fail to provide a fair comparison as they do not follow the well-established recommendation that any effects in the final analysis model (including interactions) should be included in the parametric imputation model. We show via simulation that properly incorporating interactions in the parametric imputation model leads to much better performance. In fact, correctly specified parametric imputation and tree-based random forest imputation perform similarly when estimating the interaction effect. Parametric imputation leads to slightly higher coverage for the interaction effect, but it has wider confidence intervals than random forest imputation and requires correct specification of the imputation model. Epidemiologists should take care in specifying MICE imputation models, and this paper assists in that task by providing a fair comparison of parametric and tree-based imputation in MICE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,129
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,352
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,871
Score d'incertitude au seuil0,680

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1290,352
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0030,007
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,173
Tête enseignante GPT0,494
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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