Tracheal microbial populations in horses with moderate asthma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background There are limited data on potential dysbiosis of the airway microbiota in horses with asthma. Hypothesis/Objectives We hypothesized that the respiratory microbiota of horses with moderate asthma is altered. Our objectives were (a) to quantify tracheal bacterial populations using culture and qPCR, (2) to compare aerobic culture and qPCR, and (c) to correlate bacterial populations with bronchoalveolar lavage fluid (BALF) cytology. Animals Eighteen horses with moderate asthma from a hospital population and 10 controls. Methods Prospective case-control study. Aerobic culture was performed on tracheal aspirates, and streptococci, Pasteurella multocida, Chlamydophila spp., Mycoplasma spp., as well as 16S (bacterial) and 18S (fungal) rRNA subunits were quantified by qPCR. Results Potential pathogens such as Streptococcus spp., Actinobacillus spp., and Pasteurellaceae were isolated from 8, 5, and 6 horses with asthma and 3, 0, and 2 controls, respectively. There was a positive correlation between Streptococcus spp. DNA and 16S rRNA gene (r ≥ 0.7, P ≤ 0.02 in both groups), but the overall bacterial load (16S) was lower in asthma (1.5 ± 1.3 versus 2.5 ± 0.8 × 104 copy/μL, P < 0.05). There was no association between microbial populations and clinical signs, tracheal mucus or BALF inflammation. Conclusions and Clinical Importance This study does not support that bacterial overgrowth is a common feature of chronic moderate asthma in horses. Lower bacterial load could suggest dysbiosis of the lower airways, either as a consequence of chronic inflammation or previous treatments, or as a perpetuating factor of inflammation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».