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Enregistrement W3003898936 · doi:10.5197/j.2044-0588.2020.041.011

First record of <i>Erysiphe corylacearum</i> on <i>Corylus avellana</i> in Switzerland and in central Europe

2020· article· en· W3003898936 sur OpenAlexaboutno aff
Ludwig Beenken, T. Brodtbeck, Renata De Marchi

Notice bibliographique

RevueNew Disease Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePowdery Mildew Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPowdery mildewConidiumHerbariumBotanyBiologyBetulaceaeAscocarpMycologyHorticultureTaxonomy (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

From July to November 2019, a previously unseen powdery mildew disease was found repeatedly on Corylus avellana (hazelnut) in the canton of Ticino in Switzerland. It occurred on leaves of C. avellana shrubs growing in hedges and deciduous forests dominated by Castanea sativa at six locations north of the city of Lugano around Sonvico, at altitudes ranging from 510 to 700 m. Morphological examination revealed small, white, effuse, amphigenous mycelial patches of 0.5-2 cm in diameter (Fig. 1). The ellipsoid to doliiform conidia (30-35 × 15-23 μm) were produced singly. They were mainly found in July and became rare in autumn. In contrast, the gregarious chasmothecia were common throughout the observation time. They measured 80-120 μm in diameter, had up to 14 appendices (60-100 μm long) with multiple dichotomously branched tips, and contained 2-5 obovoid asci (40-60 × 30-50 μm) with up to 8 ellipsoid ascospores (14-20 × 7-14 μm) (Fig. 2). These characters correspond to the description of E. corylacearum in Braun & Cook (3). The morphological identification was confirmed by sequencing the ITS-region of rDNA using three samples and performing a phylogenetic analysis as described in Beenken (2). PCR was done with the Erysiphales-specific primer pair PMITS1/PMITS2 (Cunnington et al., 4) to eliminate co-amplification of the fungus Ampellomyces quisqualis that parasitises E. corylacearum, as preliminary molecular and microscopic investigations on the Swiss material had shown. Obtained sequences were deposited in GenBank (Accession Nos. MN822721-MN822723). Voucher specimens were deposited in the fungal herbarium of ETH Zurich (ZT Myc 59971-ZT Myc 59973). The molecular phylogenetic analysis showed that the Swiss strains had identical ITS sequences to those of E. corylacearum from Azerbaijan, Georgia, Iran and Turkey and differed only in a few base pairs from those from China, Iran and Japan (Fig. 3). Erysiphe corylacearum is native to east Asia and has been reported from USA (Ohio) and Canada but until now it has been unknown from central Europe (Braun & Cook 3). Recently, Heluta et al. (5) reported its occurrence on C. avellana from Ukraine, but without molecular validation. The species has been reported as an invasive pathogen from hazelnut orchards in Turkey, Iran and Georgia where it caused serious damage (Arzanlou et al., 1, Meparishvili et al., 6). Despite active searching for E. corylacearum in Switzerland, it has not yet been found outside the one small area in the canton of Ticino. The pathogen differs from the native hazelnut powdery mildew Phyllactinia guttata, with which it sometimes co-occurs, by forming mycelia on the upper leaf surface and having smaller chasmothecia with branched appendices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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