Trimerization and Genotype–Phenotype Correlation of COL4A5 Mutants in Alport Syndrome
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: genes. Many clinical studies have elucidated the correlation between genotype and phenotype, but there is still much ambiguity and insufficiency. Here, we focused on the α345(IV) heterotrimerization of α5(IV) missense mutant as a novel factor to further understand the pathophysiology of Alport syndrome. METHODS: We selected 9 α5(IV) missense mutants with typical glycine substitutions that clinically differed in disease progression. To quantify the trimerization of each mutant, split nanoluciferase-fused α3/α5 mutants and α4 were transfected into the cells, and intracellular and secreted heterotrimer were detected by luminescence using an assay that we developed previously. RESULTS: Trimer formation and secretion patterns tended to be similar to the wild type in most of the mutations that did not show proteinuria at a young age. On the other hand, trimer secretion was significantly reduced in all the mutations that showed proteinuria and early onset of renal failure. One of these mutants has low ability of intracellular trimer formation, and the others had the defect of low-level secretion. In addition, the mutant that is assumed to be nonpathogenic has similar trimer formation and secretion pattern as wild-type α5(IV). CONCLUSION: The result of cell-based α345(IV) heterotrimer formation assay was largely correlated with clinical genotype-phenotype. These trimerization assessments provide additional phenotypic considerations and may help to distinguish between pathogenic and nonpathogenic mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».