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Enregistrement W3004002562 · doi:10.1002/sim.8465

Bayesian hierarchical meta‐analytic methods for modeling surrogate relationships that vary across treatment classes using aggregate data

2020· article· en· W3004002562 sur OpenAlexfundno aff
Tasos Papanikos, John R. Thompson, Keith R. Abrams, Nicolas Städler, Oriana Ciani, Rod S Taylor, Sylwia Bujkiewicz

Notice bibliographique

RevueStatistics in Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research Council CanadaMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésSurrogate endpointBayesian probabilityComputer scienceSurrogate modelSurrogate dataBayesian inferenceMeta-analysisClass (philosophy)EconometricsStatisticsData miningArtificial intelligenceMachine learningMathematicsMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Surrogate endpoints play an important role in drug development when they can be used to measure treatment effect early compared to the final clinical outcome and to predict clinical benefit or harm. Such endpoints are assessed for their predictive value of clinical benefit by investigating the surrogate relationship between treatment effects on the surrogate and final outcomes using meta-analytic methods. When surrogate relationships vary across treatment classes, such validation may fail due to limited data within each treatment class. In this paper, two alternative Bayesian meta-analytic methods are introduced which allow for borrowing of information from other treatment classes when exploring the surrogacy in a particular class. The first approach extends a standard model for the evaluation of surrogate endpoints to a hierarchical meta-analysis model assuming full exchangeability of surrogate relationships across all the treatment classes, thus facilitating borrowing of information across the classes. The second method is able to relax this assumption by allowing for partial exchangeability of surrogate relationships across treatment classes to avoid excessive borrowing of information from distinctly different classes. We carried out a simulation study to assess the proposed methods in nine data scenarios and compared them with subgroup analysis using the standard model within each treatment class. We also applied the methods to an illustrative example in colorectal cancer which led to obtaining the parameters describing the surrogate relationships with higher precision.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,126
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,181
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,874
Score d'incertitude au seuil0,666

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1260,181
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,010
Bibliométrie0,0070,006
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0050,003
Intégrité de la recherche0,0030,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,899
Tête enseignante GPT0,666
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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