MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3004027345 · doi:10.1021/jacs.9b11762

Addressing Ligand-Based Redox in Molybdenum-Dependent Methionine Sulfoxide Reductase

2020· article· en· W3004027345 sur OpenAlexaff
Laura Ingersol, Jing Yang, Khadanand KC, Amrit Pokhrel, Andrei V. Astashkin, Joël H. Weiner, Christopher A. Johnston, Martin L. Kirk

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueMetalloenzymes and iron-sulfur proteins
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésChemistryElectron paramagnetic resonanceLigand (biochemistry)RedoxMolybdenumMethionine sulfoxideMethionine sulfoxide reductaseContext (archaeology)SulfoxideElectron transferThioredoxin reductasePhotochemistryInorganic chemistryCrystallographyMethionineEnzymeOrganic chemistryThioredoxinBiochemistryNuclear magnetic resonance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A combination of pulsed EPR, CW EPR, and X-ray absorption spectroscopies has been employed to probe the geometric and electronic structure of the E. coli periplasmic molybdenum-dependent methionine sulfoxide reductase (MsrP). 17 O and 1 H pulsed EPR spectra show that the as-isolated Mo(V) enzyme form does not possess an exchangeable H 2 O/OH – ligand bound to Mo as found in the sulfite oxidizing enzymes of the same family. The nature of the unusual CW EPR spectrum has been re-evaluated in light of new data on the MsrP-N45R variant and related small-molecule analogues of the active site. These data point to a novel “thiol-blocked” [(PDT)Mo V O(S Cys )(thiolate)] − structure, which is supported by new EXAFS data. We discuss these new results in the context of ligand-based and metal-based redox chemistry in the enzymatic oxygen atom transfer reaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Chemical SocietyMême sujetMetalloenzymes and iron-sulfur proteinsTravaux en français237 207