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Enregistrement W3004200347 · doi:10.1002/ijc.32895

Cause‐specific mortality after diagnosis of cancer among HIV‐positive patients: A collaborative analysis of cohort studies

2020· article· en· W3004200347 sur OpenAlexafffund
Adam Trickey, Margaret May, M. John Gill, Sophie Grabar, Jörg Janne Vehreschild, Ferdinand W N M Wit, Fabrice Bonnet, Matthias Cavassini, Sophie Abgrall, Juan Berenguer, Christoph Wyen, Peter Reiss, Katharina Grabmeier‐Pfistershammer, Jodie L. Guest, Leah Shepherd, Ramón Teira, Antonella d’Arminio Monforte, Amy C. Justice, Dominique Costagliola, Jonathan A C Sterne

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEuropean and Developing Countries Clinical Trials PartnershipNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismMedical Research CouncilDepartment for International DevelopmentSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungMedical Research Council CanadaInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDepartment for International Development, UK GovernmentEuropean CommissionNational Science FoundationCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchMinisterio de Ciencia e InnovaciónStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésMedicineCohortHuman immunodeficiency virus (HIV)Cohort studyCancerOncologyInternal medicineDemographyFamily medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

People living with HIV (PLHIV) are more likely than the general population to develop AIDS-defining malignancies (ADMs) and several non-ADMs (NADMs). Information is lacking on survival outcomes and cause-specific mortality after cancer diagnosis among PLHIV. We investigated causes of death within 5 years of cancer diagnosis in PLHIV enrolled in European and North American HIV cohorts starting antiretroviral therapy (ART) 1996-2015, aged ≥16 years, and subsequently diagnosed with cancer. Cancers were grouped: ADMs, viral NADMs and nonviral NADMs. We calculated cause-specific mortality rates (MR) after diagnosis of specific cancers and compared 5-year survival with the UK and France general populations. Among 83,856 PLHIV there were 4,436 cancer diagnoses. Of 603 deaths after ADM diagnosis, 292 (48%) were due to an ADM. There were 467/847 (55%) and 74/189 (39%) deaths that were due to an NADM after nonviral and viral NADM diagnoses, respectively. MR were higher for diagnoses between 1996 and 2005 versus 2006-2015: ADMs 102 (95% CI 92-113) per 1,000 years versus 88 (78-100), viral NADMs 134 (106-169) versus 111 (93-133) and nonviral NADMs 264 (232-300) versus 226 (206-248). Estimated 5-year survival for PLHIV diagnosed with liver (29% [19-39%]), lung (18% [13-23%]) and cervical (75% [63-84%]) cancer was similar to general populations. Survival after Hodgkin's lymphoma diagnosis was lower in PLHIV (75% [67-81%]). Among ART-treated PLHIV diagnosed with cancer, MR and causes of death varied by cancer type, with mortality highest for liver and lung cancers. Deaths within 5 years of NADM diagnoses were more likely to be from cancer than AIDS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,030
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,030
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,008
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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