Innate and Adaptive Immune Correlates of Chronic and Self-limiting EBV DNAemia in Solid-organ Transplant Recipients
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Epstein-Barr virus (EBV) DNAemia is a major risk factor for posttransplant lymphoproliferative disorder; however, immune correlates of EBV DNAemia in the transplant setting are limited. METHODS: Peripheral blood mononuclear cells were collected from 30 transplant recipients with self-limiting EBV DNAemia (SLD; n = 11) or chronic EBV DNAemia (CD; n = 19) at enrollment and 4-8 weeks later. Mass cytometry was used to characterize innate and T-cell immune correlates of EBV DNAemia. Furthermore, flow cytometry was used to measure the frequency of EBV-specific T-cell responses between groups following stimulation with an EBV-infected cell lysate. RESULTS: Unsupervised analysis of the innate compartment (CD3CD19 cells) identified 5 CD11c clusters at higher abundance in the SLD group (false discovery rate ≤ 1%). These clusters expressed CD11b, CD45RO, CD14, CD123, CD127, and CD38, among others. Unsupervised profiling of the T-cell compartment (CD3CD19) revealed 2 CD4 T-cell clusters at higher frequency among those with SLD (false discovery rate ≤ 1%), which expressed CD45RA, CCR7, CD27, CD28, and CD40L-suggestive of a naive T cell (TN). Manual biaxial gating confirmed increased frequencies of conventional dendritic cells (3.1% versus 2.1%; P = 0.023) and CD4 TN (4.4% versus 1.9%; P = 0.018) among those with SLD. Last, frequencies of interferon-γ-producing EBV-specific CD4 T cells were significantly lower in the CD group relative to those with SLD (4243 versus 250 cells/10 cells; P = 0.015). CONCLUSIONS: CD is associated with a reduction of CD11c cells, CD4 TN, and interferon-γ-producing EBV-specific CD4 T cells, suggesting an interplay between innate and adaptive immune compartments may be important for regulating EBV DNAemia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».