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Enregistrement W3004334080 · doi:10.1097/tp.0000000000003130

Innate and Adaptive Immune Correlates of Chronic and Self-limiting EBV DNAemia in Solid-organ Transplant Recipients

2020· article· en· W3004334080 sur OpenAlexaff
Victor H. Ferreira, Judah Batist, Atul Humar, Deepali Kumar

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunologyCD38CD8T cellInterleukin-7 receptorImmune systemCD19ImmunophenotypingCD11cBiologyMedicineFlow cytometryVirologyIL-2 receptorStem cellPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Epstein-Barr virus (EBV) DNAemia is a major risk factor for posttransplant lymphoproliferative disorder; however, immune correlates of EBV DNAemia in the transplant setting are limited. METHODS: Peripheral blood mononuclear cells were collected from 30 transplant recipients with self-limiting EBV DNAemia (SLD; n = 11) or chronic EBV DNAemia (CD; n = 19) at enrollment and 4-8 weeks later. Mass cytometry was used to characterize innate and T-cell immune correlates of EBV DNAemia. Furthermore, flow cytometry was used to measure the frequency of EBV-specific T-cell responses between groups following stimulation with an EBV-infected cell lysate. RESULTS: Unsupervised analysis of the innate compartment (CD3CD19 cells) identified 5 CD11c clusters at higher abundance in the SLD group (false discovery rate ≤ 1%). These clusters expressed CD11b, CD45RO, CD14, CD123, CD127, and CD38, among others. Unsupervised profiling of the T-cell compartment (CD3CD19) revealed 2 CD4 T-cell clusters at higher frequency among those with SLD (false discovery rate ≤ 1%), which expressed CD45RA, CCR7, CD27, CD28, and CD40L-suggestive of a naive T cell (TN). Manual biaxial gating confirmed increased frequencies of conventional dendritic cells (3.1% versus 2.1%; P = 0.023) and CD4 TN (4.4% versus 1.9%; P = 0.018) among those with SLD. Last, frequencies of interferon-γ-producing EBV-specific CD4 T cells were significantly lower in the CD group relative to those with SLD (4243 versus 250 cells/10 cells; P = 0.015). CONCLUSIONS: CD is associated with a reduction of CD11c cells, CD4 TN, and interferon-γ-producing EBV-specific CD4 T cells, suggesting an interplay between innate and adaptive immune compartments may be important for regulating EBV DNAemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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