Towards the implementation of a DNA barcode library for the identification of Peruvian species of Anastrepha (Diptera: Tephritidae)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The genus Anastrepha is a diverse lineage of fruit-damaging tephritid flies widespread across the Neotropical Region. Accurate taxonomic identification of these flies is therefore of paramount importance in agricultural contexts. DNA barcoding libraries are molecular-based tools based on a short sequence of the mitochondrial COI gene enabling rapid taxonomic identification of biological species. In this study, we evaluate the utility of this method for species identification of Peruvian species of Anastrepha and assemble a preliminary barcode profile for the group. We obtained 73 individual sequences representing the 15 most common species, 13 of which were either assigned to previously recognized or newly established BINs. Intraspecific genetic divergence between sampled species averaged 1.01% (range 0-3.3%), whereas maximum interspecific values averaged 8.67 (range 8.26-17.12%). DNA barcoding was found to be an effective method to discriminate between many Peruvian species of Anastrepha that were tested, except for most species of the fraterculus species group, which were all assigned to the same BIN as they shared similar and, in some cases, identical barcodes. We complemented this newly produced dataset with 86 published sequences to build a DNA barcoding library of 159 sequences representing 56 Peruvian species of Anastrepha (approx. 58% of species reported from that country). We conclude that DNA barcoding is an effective method to distinguish among Peruvian species of Anastrepha outside the fraterculus group, and that complementary methods (e.g., morphometrics, additional genetic markers) would be desirable to assist sensu stricto species identification for phytosanitary surveillance and management practices of this important group of pestiferous flies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle