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Enregistrement W3004366129 · doi:10.1073/pnas.1921730117

Cystic fibrosis heterozygosity: Carrier state or haploinsufficiency?

2020· letter· en· W3004366129 sur OpenAlexaff
David N. Fisman

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2020
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosisHaploinsufficiencyCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorPopulationAlleleBronchiectasisCompound heterozygosityBiologyGeneticsHeterozygote advantageImmunologyMedicineInternal medicineGeneLungPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic fibrosis (CF) is a common genetic disorder, caused by mutation in the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene. The CFTR gene encodes a transmembrane chloride channel, which is important for key physiological functions, such as production of sweat and mucus, as well as mucociliary clearance in the lungs (1). Affected individuals are homozygous for mutated copies of CFTR and are at elevated risk for a variety of diseases, including bronchiectasis and repeated pulmonary infection; gastrointestinal disorders, including malabsorption and nutritional deficiency states; and pancreatitis and diseases of the hepatobiliary system (1). While management of CF has improved drastically in recent decades, individuals with CF experience reduced life expectancy relative to the general population (2). The prevalence of carrier state of mutated CFTR genes is high [greater than 3% in some subpopulations (3)], leading to the suggestion that the carrier state must be positively selected for due to positive health effects, analogous to protection against malaria conferred by carrier states in sickle cell anemia (4, 5). CF has been regarded as a classical autosomal recessive disorder, with no adverse health effects associated with the carrier state. I use the past tense, because in PNAS Miller et al. (6) provide convincing evidence that CF heterozygosity may represent a haploinsufficiency state, analogous to that seen with thalassemia, where individuals with a single copy of the disease-causing allele do suffer adverse health effects, presumably due to production of the gene’s product at lower levels than would be seen in noncarriers. Beta-thalassemia is an autosomal recessive disorder of hemoglobin, but the carrier state is often characterized as “thalassemia minor” with individuals experiencing … [↵][1]1Email: david.fisman{at}utoronto.ca. [1]: #xref-corresp-1-1

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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