Cystic fibrosis heterozygosity: Carrier state or haploinsufficiency?
Notice bibliographique
Résumé
Cystic fibrosis (CF) is a common genetic disorder, caused by mutation in the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene. The CFTR gene encodes a transmembrane chloride channel, which is important for key physiological functions, such as production of sweat and mucus, as well as mucociliary clearance in the lungs (1). Affected individuals are homozygous for mutated copies of CFTR and are at elevated risk for a variety of diseases, including bronchiectasis and repeated pulmonary infection; gastrointestinal disorders, including malabsorption and nutritional deficiency states; and pancreatitis and diseases of the hepatobiliary system (1). While management of CF has improved drastically in recent decades, individuals with CF experience reduced life expectancy relative to the general population (2). The prevalence of carrier state of mutated CFTR genes is high [greater than 3% in some subpopulations (3)], leading to the suggestion that the carrier state must be positively selected for due to positive health effects, analogous to protection against malaria conferred by carrier states in sickle cell anemia (4, 5). CF has been regarded as a classical autosomal recessive disorder, with no adverse health effects associated with the carrier state. I use the past tense, because in PNAS Miller et al. (6) provide convincing evidence that CF heterozygosity may represent a haploinsufficiency state, analogous to that seen with thalassemia, where individuals with a single copy of the disease-causing allele do suffer adverse health effects, presumably due to production of the gene’s product at lower levels than would be seen in noncarriers. Beta-thalassemia is an autosomal recessive disorder of hemoglobin, but the carrier state is often characterized as “thalassemia minor” with individuals experiencing … [↵][1]1Email: david.fisman{at}utoronto.ca. [1]: #xref-corresp-1-1
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».