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Enregistrement W3004405112 · doi:10.1038/s41467-020-14360-7

Loss-of-function mutations in UDP-Glucose 6-Dehydrogenase cause recessive developmental epileptic encephalopathy

2020· article· en· W3004405112 sur OpenAlexafffund
Holger Hengel, Célia Bosso-Lefèvre, George Grady, Emmanuelle Szenker‐Ravi, Hankun Li, Sarah B. Pierce, Élise Lebigot, Thong-Teck Tan, Michelle Eio, Gunaseelan Narayanan, Kagistia Hana Utami, Monica Yau, Nader Handal, Werner Deigendesch, Reinhard Keimer, Hiyam Marzouqa, Meral Gunay‐Aygun, Michael Muriello, Hélène Verhelst, Sarah Weckhuysen, Sonal Mahida, Sakkubai Naidu, Terrence Thomas, Jiin Ying Lim, Ee Shien Tan, Damien Haye, Michèl A.A.P. Willemsen, Renske Oegema, Wendy G. Mitchell, Tyler Mark Pierson, Marisa V. Andrews, Marcia Willing, Lance H. Rodan, Tahsin Stefan Barakat, Marjon van Slegtenhorst, Ralitza H. Gavrilova, Diego Martinelli, Tal Gilboa, Abdullah Tamim, Moeenaldeen AlSayed, Maha Abdulrahim, Mohammed Al‐Owain, Ali Awaji, Adel Mahmoud, Eissa Faqeih, Ali Al Asmari, Sulwan Algain, Lamyaa Jad, Hesham Aldhalaan, Ingo Helbig, David A. Koolen, Angelika Rieß, Ingeborg Kraegeloh‐Mann, Peter Bauer, Süleyman Gülsüner, Hannah Stamberger, Alvin Yu Jin Ng, Sha Tang, Sumanty Tohari, Boris Keren, Laura Schultz‐Rogers, Eric W. Klee, Sabina Barresi, Marco Tartaglia, Hagar Mor‐Shaked, Sateesh Maddirevula, Amber Begtrup, Aida Telegrafi, Rolph Pfundt, Rebecca Schüle, Brian Ciruna, Carine Bonnard, Mahmoud A. Pouladi, James Stewart, Adam Claridge‐Chang, Dirk J. Lefeber, Fowzan S. Alkuraya, Ajay S. Mathuru, Byrappa Venkatesh, Joseph Barycki, Melanie A. Simpson, Saumya Shekhar Jamuar, Lüdger Schöls, Bruno Reversade

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiomedical Research CouncilNational Medical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFondazione Bambino GesùUniversiteit AntwerpenFonds Wetenschappelijk OnderzoekZonMwVlaamse regeringEuropean CommissionMedical Research CouncilOspedale Pediatrico Bambino GesùNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of WashingtonNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekFRAXA Research Foundation
Mots-clésPhenocopyBiologyMutationZebrafishGeneticsGlobal developmental delayMutantPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Developmental epileptic encephalopathies are devastating disorders characterized by intractable epileptic seizures and developmental delay. Here, we report an allelic series of germline recessive mutations in UGDH in 36 cases from 25 families presenting with epileptic encephalopathy with developmental delay and hypotonia. UGDH encodes an oxidoreductase that converts UDP-glucose to UDP-glucuronic acid, a key component of specific proteoglycans and glycolipids. Consistent with being loss-of-function alleles, we show using patients' primary fibroblasts and biochemical assays, that these mutations either impair UGDH stability, oligomerization, or enzymatic activity. In vitro, patient-derived cerebral organoids are smaller with a reduced number of proliferating neuronal progenitors while mutant ugdh zebrafish do not phenocopy the human disease. Our study defines UGDH as a key player for the production of extracellular matrix components that are essential for human brain development. Based on the incidence of variants observed, UGDH mutations are likely to be a frequent cause of recessive epileptic encephalopathy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,436
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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