MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3004496476 · doi:10.1038/s41598-020-59072-6

Alkyladenine DNA glycosylase deficiency uncouples alkylation-induced strand break generation from PARP-1 activation and glycolysis inhibition

2020· article· en· W3004496476 sur OpenAlexaff
Fahad A. Alhumaydhi, Débora de Oliveira Lopes, Diana L. Bordin, Abdullah S. M. Aljohani, Cameron B. Lloyd, Michael McNicholas, Larissa Milano, Clara Forrer Charlier, Izabel Vianna Villela, João Antônio Pêgas Henriques, Kathryn E. Plant, Ruan Elliott, Lisiane B. Meira

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensHéma-Québec
Organismes subventionnairesUniversity of SurreyCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorQassim UniversityConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoRoyal Society of Medicine
Mots-clésNAD+ kinasePoly ADP ribose polymeraseDNA glycosylaseDNA repairDNA damageNicotinamide phosphoribosyltransferaseMethyl methanesulfonateBiologyBiochemistryBase excision repairMolecular biologyCell biologyChemistryDNAEnzymePolymerase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract DNA alkylation damage is repaired by base excision repair (BER) initiated by alkyladenine DNA glycosylase (AAG). Despite its role in DNA repair, AAG-initiated BER promotes cytotoxicity in a process dependent on poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1); a NAD+-consuming enzyme activated by strand break intermediates of the AAG-initiated repair process. Importantly, PARP-1 activation has been previously linked to impaired glycolysis and mitochondrial dysfunction. However, whether alkylation affects cellular metabolism in the absence of AAG-mediated BER initiation is unclear. To address this question, we temporally profiled repair and metabolism in wild-type and Aag−/− cells treated with the alkylating agent methyl methanesulfonate (MMS). We show that, although Aag−/− cells display similar levels of alkylation-induced DNA breaks as wild type, PARP-1 activation is undetectable in AAG-deficient cells. Accordingly, Aag−/− cells are protected from MMS-induced NAD+ depletion and glycolysis inhibition. MMS-induced mitochondrial dysfunction, however, is AAG-independent. Furthermore, treatment with FK866, a selective inhibitor of the NAD+ salvage pathway enzyme nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT), synergizes with MMS to induce cytotoxicity and Aag−/− cells are resistant to this combination FK866 and MMS treatment. Thus, AAG plays an important role in the metabolic response to alkylation that could be exploited in the treatment of conditions associated with NAD+ dysregulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetPARP inhibition in cancer therapyTravaux en français237 207