Kinetics of DNA damage repair response accompanying initial hepadnavirus-host genomic integration in woodchuck hepatitis virus infection of hepatocyte
Notice bibliographique
Résumé
Mechanism of initial hepatitis B virus (HBV) integrations and kinetics of DNA repair immediately after infection remain essentially unknown impairing understanding of hepadnaviral oncogenesis. WCM260 hepatocytes susceptible to HBV-compatible woodchuck hepatitis virus (WHV) were examined from 15 min to 72 h post-infection (p.i.). WHV strongly induced reactive oxygen species (ROS), transiently inducible nitric oxide (iNOS) and DNA damage from 15 min p.i. All initial WHV-host fusions had the head-to-tail format indicating their formation by non-homologous end joining (NHEJ). Transcription of poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1) and X-ray repair cross-complementing protein 1 (XRCC1), the PARP1 binding partner, were induced in 30 min p.i. and that of 8-oxyguanine DNA glycosylse (OGG1) responding to oxidative DNA damage at 12 h p.i. Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD + ), a marker of PARP1 activation, and heme oxygenase-1 (HO1), an indicator of pro-oxidative stress, were significantly augmented from 15-30 min p.i. Additionally, PARP1 cleavage activity was evident from 30 min p.i. confirming that PARP1-mediated DNA repair became operational almost instatly after hepatocyte contact with virus. By applying complementary approaches, the study showed that initial WHV integration was due to virus-induced oxidative DNA damage and implied that the NHEJ PARP1-dependent repair pathway determined format of the first virus-host DNA junctions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».