Serum levels of <i>hsa‐miR‐16‐5p</i>, <i>hsa‐miR‐29a‐3p</i>, <i>hsa‐miR‐150‐5p</i>, <i>hsa‐miR‐155‐5p</i> and <i>hsa‐miR</i>‐<i>223‐3p</i> and subsequent risk of chronic lymphocytic leukemia in the EPIC study
Notice bibliographique
Résumé
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is an incurable disease accounting for almost one‐third of leukemias in the Western world. Aberrant expression of microRNAs (miRNAs) is a well‐established characteristic of CLL, and the robust nature of miRNAs makes them eminently suitable liquid biopsy biomarkers. Using a nested case–control study within the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC), the predictive values of five promising human miRNAs (hsa‐miR‐16‐5p, hsa‐miR‐29a‐3p, hsa‐miR‐150‐5p, hsa‐miR‐155‐5p and hsa‐miR‐223‐3p), identified in a pilot study, were examined in serum of 224 CLL cases (diagnosed 3 months to 18 years after enrollment) and 224 matched controls using Taqman based assays. Conditional logistic regressions were applied to adjust for potential confounders. The median time from blood collection to CLL diagnosis was 10 years (p25–p75: 7–13 years). Overall, the upregulation of hsa‐miR‐150‐5p, hsa‐miR‐155‐5p and hsa‐miR‐29a‐3p was associated with subsequent risk of CLL [OR1∆Ct‐unit increase (95%CI) = 1.42 (1.18–1.72), 1.64 (1.31–2.04) and 1.75 (1.31–2.34) for hsa‐miR‐150‐5p, hsa‐miR‐155‐5p and hsa‐miR‐29a‐3p, respectively] and the strongest associations were observed within 10 years of diagnosis. However, the predictive performance of these miRNAs was modest (area under the curve <0.62). hsa‐miR‐16‐5p and hsa‐miR‐223‐3p levels were unrelated to CLL risk. The findings of this first prospective study suggest that hsa‐miR‐29a, hsa‐miR‐150‐5p and hsa‐miR‐155‐5p were upregulated in early stages of CLL but were modest predictive biomarkers of CLL risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».