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Enregistrement W3004856580 · doi:10.1371/journal.pone.0228633

Exploratory examination of inflammation state, immune response and blood cell composition in a human obese cohort to identify potential markers predicting cancer risk

2020· article· en· W3004856580 sur OpenAlexafffund
Ingrid Elisia, Vivian Lam, Brandon Cho, Mariah Hay, Michael Y. Li, Jordanna Kapeluto, Tom Elliott, David Harris, Luke Bu, William Jia, Hilary Leung, William W. Mohn, Gerald Krystal

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipokines, Inflammation, and Metabolic Diseases
Établissements canadiensRichmond HospitalUniversity of British ColumbiaDiabetes CanadaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesLotte and John Hecht Memorial Foundation
Mots-clésMedicineInflammationImmunologyImmune systemCancerChemokineInternal medicineType 2 diabetesPeripheral blood mononuclear cellDiabetes mellitusEndocrinologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obesity has reached epidemic proportions and is often accompanied by elevated levels of pro-inflammatory cytokines that promote many chronic diseases, including cancer. However, not all obese people develop these diseases and it would be very helpful to identify those at high risk early on so that preventative measures can be instituted. We performed an extensive evaluation of the effects of obesity on inflammatory markers, on innate and adaptive immune responses, and on blood cell composition to identify markers that might be useful in distinguishing those at elevated risk of cancer. Plasma samples from 42 volunteers with a BMI>35 had significantly higher CRP, PGE2, IL-1RA, IL-6 and IL-17 levels than 34 volunteers with normal BMIs. Of the cytokines and chemokines tested, only IL-17 was significantly higher in men with a BMI>35 than women with a BMI>35. As well, only IL-17 was significantly higher in those with a BMI>35 that had type 2 diabetes versus those without type 2 diabetes. Whole blood samples from participants with a BMI>35, when challenged with E. coli, produced significantly higher levels of IL-1RA while HSV-1 challenge resulted in significantly elevated IL-1RA and VEGF, and a non-significant increase in G-CSF and IL-8 levels. T cell activation of PBMCs, via anti-CD3 plus anti-CD28, resulted in significantly higher IFNγ production from volunteers with a BMI>35. In terms of blood cells, red blood cell distribution width (RDW), monocytes, granulocytes, CD4+T cells and Tregs were all significantly higher while, natural killer (NK) and CD8+ T cells were all significantly lower in the BMI>35 cohort, suggesting that obesity may reduce the ability to kill nascent tumor cells. Importantly, however, there was considerable person-to-person variation amongst participants with a BMI>35, with some volunteers showing markedly different values from controls and others showing normal levels of many parameters measured. These person-to-person variations may prove useful in identifying those at high risk of developing cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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