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Enregistrement W3004883366 · doi:10.1200/jco.2020.38.4_suppl.235

BRCA mutations in metastatic colorectal cancer (mCRC) and response to chemotherapy.

2020· article· en· W3004883366 sur OpenAlexafffundabout
Sophie Feng, Laith Al-Showbaki, Monika K. Krzyzanowska, Rebecca M. Prince, Tracy Stockley, Celeste Yu, Philippe L. Bédard, Lillian L. Siu, Eric Xueyu Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesPrincess Margaret Cancer Foundation
Mots-clésMedicineColorectal cancerKRASOncologyInternal medicineOlaparibOxaliplatinChemotherapyPARP inhibitorCancerCancer researchGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

235 Background: Mutations in BRCA 1/2 are typically associated with breast, ovarian, pancreatic and prostate cancers. BRCA mutations have been reported in colorectal cancer in sporadic case series. Unlike other cancers, the significance of BRCA mutations in mCRC is not known. We report the prevalence and molecular characteristics associated with BRCA 1/2 mutations in mCRC, and investigate the impact of these mutations on chemotherapy response since both oxaliplatin (OX) and irinotecan (IRI) interfere with DNA repair pathways. Methods: The Ontario-wide Cancer Targeted Nucleic Acid Evaluation (OCTANE) database was queried to identify mCRC patients (pts) harbouring BRCA 1/2 mutations. BRCA 1/2 mutations were detected using panel-based next generation sequencing (NGS) on archival tumour tissue. Clinical and molecular variables were collected, together with treatment outcomes. Results: Of 279 mCRC pts within the OCTANE database as of March 2019, 9 pts with BRCA 1/2 mutations were identified (3.2%): 4 BRCA 1 and 5 BRCA 2 mutations. Each patient had a unique variant with 8/9 missense mutations and 1/9 splicing error. Allele frequency ranged from 0.11 to 0.57. RAS or BRAF mutations were present in 67%. Common co-mutations included TP53 (56%), APC (56%), TSC1 (44%), ROS1 (33%) and ATM(33%). 2 pts were mismatch repair deficient. Median age was 48.5 years (range: 31-69 years), 56% males. 5 pts presented with de novo metastatic disease. First line OX-containing chemotherapy was administered to 4 pts, and IRI to 3 pts. 2 pts did not receive chemotherapy (1 had surgery only post-adjuvant OX, and 1 immunotherapy). Overall response rate (ORR) was 71%, with all pts achieving a partial response or stable disease. The median progression-free survival was 7.5 months (range: 1.8- 31.7 months) and median overall survival 68.5 months (range: 10.5- 68.5 months) respectively. Conclusions: BRCA 1/2 mutations are present in a small subset of mCRC pts. Pts with these mutations tend to be younger at diagnosis. BRCA 1/2 mutations are associated with favourable response to first line chemotherapy. Targeting BRCA 1/2 mutations may broaden treatment options for these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,100

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,456
Écart entre enseignants0,376 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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