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Enregistrement W3004891841 · doi:10.1101/2020.02.10.941336

Measuring protected-area outcomes with leech iDNA: large-scale quantification of vertebrate biodiversity in Ailaoshan nature reserve

2020· preprint· en· W3004891841 sur OpenAlexaff
Christopher C. M. Baker, Yinqiu Ji, Viorel D. Popescu, Jiaxin Wang, Chunying Wu, Zhengyang Wang, Yuanheng Li, Lin Wang, Chaolang Hua, Yang Zhong-xing, Chunyan Yang, Charles C.Y. Xu, Alex Diana, Qingzhong Wen, Naomi E. Pierce, Douglas W. Yu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesUnitatea Executiva pentru Finantarea Invatamantului Superior, a Cercetarii, Dezvoltarii si InovariiAutoritatea Natională pentru Cercetare StiintificăLeverhulme TrustHarvard UniversityNational Natural Science Foundation of ChinaFAS Division of Science, Harvard UniversityHarvard Global InstituteDirectorate for Biological SciencesChinese Academy of Sciences
Mots-clésMammalBiodiversityVertebrateSpecies richnessEcologyNature reserveBiologyOccupancyProtected areaGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1 Abstract Protected areas are central to meeting biodiversity conservation goals, but measuring their effectiveness is challenging. We address this challenge by using DNA from leech-ingested bloodmeals to estimate vertebrate occupancies across the 677 km 2 Ailaoshan reserve in Yunnan, China. 163 park rangers collected 30,468 leeches from 172 patrol areas. We identified 86 vertebrate species, including amphibians, mammals, birds, and squamates. Multi-species occupancy modelling showed that species richness increased with elevation and distance to reserve edge, including the distributions of most of the large mammals (e.g. sambar, black bear, serow, tufted deer). The exceptions were the three domestic mammal species (cows, sheep, goats) and muntjak deer, which were more common at lower elevations. eDNA-estimated vertebrate occupancies are Granular, Repeatable, Auditable, Direct, Efficient , and Simple-to-understand measures that can be used to assess conservation effectiveness and thus to improve the contributions that protected areas make to achieving global biodiversity goals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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