Identifying mechanisms of genetic differentiation among populations in vagile species: historical factors dominate genetic differentiation in seabirds
Notice bibliographique
Résumé
Elucidating the factors underlying the origin and maintenance of genetic variation among populations is crucial for our understanding of their ecology and evolution, and also to help identify conservation priorities. While intrinsic movement has been hypothesized as the major determinant of population genetic structuring in abundant vagile species, growing evidence indicates that vagility does not always predict genetic differentiation. However, identifying the determinants of genetic structuring can be challenging, and these are largely unknown for most vagile species. Although, in principle, levels of gene flow can be inferred from neutral allele frequency divergence among populations, underlying assumptions may be unrealistic. Moreover, molecular studies have suggested that contemporary gene flow has often not overridden historical influences on population genetic structure, which indicates potential inadequacies of any interpretations that fail to consider the influence of history in shaping that structure. This exhaustive review of the theoretical and empirical literature investigates the determinants of population genetic differentiation using seabirds as a model system for vagile taxa. Seabirds provide a tractable group within which to identify the determinants of genetic differentiation, given their widespread distribution in marine habitats and an abundance of ecological and genetic studies conducted on this group. Herein we evaluate mitochondrial DNA (mtDNA) variation in 73 seabird species. Lack of mutation-drift equilibrium observed in 19% of species coincided with lower estimates of genetic differentiation, suggesting that dynamic demographic histories can often lead to erroneous interpretations of contemporary gene flow, even in vagile species. Presence of land across the species sampling range, or sampling of breeding colonies representing ice-free Pleistocene refuge zones, appear to be associated with genetic differentiation in Tropical and Southern Temperate species, respectively, indicating that long-term barriers and persistence of populations are important for their genetic structuring. Conversely, biotic factors commonly considered to influence population genetic structure, such as spatial segregation during foraging, were inconsistently associated with population genetic differentiation. In light of these results, we recommend that genetic studies should consider potential historical events when identifying determinants of genetic differentiation among populations to avoid overestimating the role of contemporary factors, even for highly vagile taxa.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».