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Enregistrement W3005272128 · doi:10.1038/s41396-020-0597-3

Insights into the bioavailability of oceanic dissolved Fe from phytoplankton uptake kinetics

2020· article· en· W3005272128 sur OpenAlexafffund
Yeala Shaked, Kristen N. Buck, Travis Mellett, María T. Maldonado

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaIsrael Science FoundationArmenian National Science and Education FundNational Science Foundation
Mots-clésSeawaterPhytoplanktonBioavailabilityEnvironmental chemistryChemical oceanographyGenetic algorithmOceanographySiderophoreBiologyChemistryEcologyNutrientMicroorganismGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

. The bioavailability of dFe in seawater is however difficult to appraise since it is bound by a variety of poorly characterized organic ligands. Here, we propose a new approach for evaluating seawater dFe bioavailability based on its uptake rate constant by Fe-limited cultured phytoplankton. We utilized seven phytoplankton species of diverse classes, sizes, and provenances to probe for dFe bioavailability in 12 seawater samples from several ocean basins and depths. All tested phytoplankton acquired organically bound Fe in any given sample at similar rates (after normalizing to cellular surface area), confirming that multiple, Fe-limited phytoplankton species can be used to probe dFe bioavailability in seawater. These phytoplankton-based uptake rate constants allowed us to compare water types, and obtain a grand average estimate of seawater dFe bioavailability. Among water types, dFe bioavailability varied by approximately four-fold, and did not clearly correlate with Fe concentrations or any of the measured Fe speciation parameters. Compared with well-studied Fe complexes, seawater dFe is more available than model siderophore Fe, but less available than inorganic Fe. Exposure of seawater to sunlight, however, significantly enhanced dFe bioavailability. The rate constants established in this work, not only facilitate comparison between water types, but also allow calculation of Fe uptake rates by phytoplankton in the ocean based on measured dFe concentrations. The approach established and verified in this study, opens a new way for determining dFe bioavailability in samples across the ocean, and enables modeling of in situ Fe uptake rates by phytoplankton using dFe concentrations from GEOTRACES datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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