Clinical and molecular profiling of locally advanced compared with metastatic pancreatic adenocarcinoma.
Notice bibliographique
Résumé
747 Background: It is unclear whether locally advanced pancreatic cancer (LAPC) should be treated similarly to metastatic pancreatic cancer (MPC). Clinical trials often exclude LAPC. We compare clinical and genomic characteristics of LAPC and MPC. Methods: Patients with LAPC and MPC were enrolled in the COMPASS trial (NCT02750657). Clinical, demographic and survival data was collected (cut off 8/31/19). WGS, RNAseq and modified Moffitt classification was performed. Results: Patients with LAPC (n = 28) and MPC (n = 180) did not differ in terms of age, gender, smoking or diabetes history. Patients with LAPC had lower BMI (p = 0.005) and lower baseline Ca19-9 (p = 0.02) than those with MPC. LAPC/MPC tumors had similar rates of KRAS, p53, CDKN2A and SMAD4 mutations and similar levels of ploidy, indels and neoantigens. There were increases in single nucleotide variants (p = 0.026) and structural variants (p = 0.04) in MPC compared with LAPC. No LAPC tumors were homologous recombination deficient (HRD) or KRAS wild type (WT), compared with 14 (8%) HRD and 16 (9%) KRAS-WT MPC. All LAPC were classical subtype compared with 77% MPC (p = 0.0052). OS data is shown in the table. MPC classical subtype tumors had improved OS compared with basal-like tumors (p = 0.008). Patients with MPC and p53 mutation trended towards worse OS compared with those without p53 mutation (p = 0.07); this was not seen in LAPC. There was a significant correlation between time on chemotherapy and OS in LAPC (p = 0.002) and MPC (p < 0.0001). Conclusions: Patients with LAPC have similar molecular profiles to those with MPC with similar rates of altered drivers. LAPC tumors are more likely to be Moffitt classical subtype and have similar OS to classical subtype MPC. LAPC patients benefit from local therapy; all patients benefit from increased time on chemotherapy. These data suggest that patients with LAPC should be treated similarly to those with classical subtype MPC but should be offered local therapy when possible. Clinical trial information: NCT02750657 . [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».